More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2274 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2274  glutamine amidotransferase, class-II  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0107042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2583  glutamine amidotransferase, class-II protein  96.08 
 
 		 306 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0230258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3467  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  84.9 
 
 		 299 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2248  glutamine amidotransferase class-II  83.39 
 
 		 301 aa  524  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280725 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1346  glutamine amidotransferase, class-II  66.56 
 
 		 299 aa  434  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1656  glutamine amidotransferase class-II  59.28 
 
 		 311 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1575  glutamine amidotransferase class-II  59.93 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1938  glutamine amidotransferase class-II  58.96 
 
 		 311 aa  363  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.210707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4695  glutamine amidotransferase class-II  59.87 
 
 		 299 aa  360  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.903048 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1870  putative glutamine amidotransferase  57.79 
 
 		 308 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117624  normal  0.828633 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5638  glutamine amidotransferase class-II  56.95 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.52916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3291  glutamine amidotransferase class-II  58.8 
 
 		 301 aa  352  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6008  glutamine amidotransferase class-II  57.24 
 
 		 301 aa  352  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.362161  decreased coverage  0.00354269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4810  glutamine amidotransferase class-II  60.86 
 
 		 297 aa  352  4e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  hitchhiker  0.00206329 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6575  glutamine amidotransferase class-II  56.33 
 
 		 302 aa  351  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0505165 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5749  amidophosphoribosyltransferase  57.28 
 
 		 301 aa  351  8.999999999999999e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2632  glutamine amidotransferase class-II  56.19 
 
 		 299 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1942  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  55.7 
 
 		 297 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.738445 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1138  glutamine amidotransferase, class-II  59.33 
 
 		 298 aa  332  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.16804 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1699  glutamine amidotransferase class-II  51.01 
 
 		 296 aa  308  6.999999999999999e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0457  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  47.47 
 
 		 298 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.598323  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0167  glutamine amidotransferase class-II  47.51 
 
 		 302 aa  299  3e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2499  glutamate synthase (NADPH) GltB1 subunit  48.67 
 
 		 305 aa  299  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0705172  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3033  glutamine amidotransferase, class-II  48.17 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5919  glutamine amidotransferase class-II  48 
 
 		 302 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3524  glutamine amidotransferase class-II  48.17 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0234475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4806  glutamine amidotransferase class-II  46.03 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1299  glutamine amidotransferase, class-II  43.71 
 
 		 302 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0375941  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5261  glutamine amidotransferase, class-II  45.87 
 
 		 298 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.228434 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4893  glutamine amidotransferase, class-II  45.87 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4982  glutamine amidotransferase, class-II  45.87 
 
 		 298 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5510  glutamine amidotransferase, class-II  44.37 
 
 		 302 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.623211  normal  0.154748 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1778  hypothetical protein  33.33 
 
 		 475 aa  89  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000929805  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  30.95 
 
 		 488 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1389  amidophosphoribosyltransferase  32.53 
 
 		 479 aa  87.8  2e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.254172  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0230  amidophosphoribosyltransferase  34.13 
 
 		 463 aa  86.3  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  29.8 
 
 		 487 aa  85.9  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  29.59 
 
 		 474 aa  85.9  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0731  amidophosphoribosyltransferase  32.95 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0007  amidophosphoribosyltransferase  33.95 
 
 		 487 aa  82.8  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30048  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1740  glutamate synthase alpha subunit domain protein  25 
 
 		 659 aa  82  0.00000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.627915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  31.07 
 
 		 463 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  32.42 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  31.63 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2179  amidophosphoribosyltransferase  31.74 
 
 		 462 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0228  amidophosphoribosyltransferase  30.54 
 
 		 478 aa  79.7  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.629689  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2095  amidophosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 480 aa  79.3  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.778059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  31.28 
 
 		 480 aa  79.3  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1147  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 478 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.218005  normal  0.314166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0655  amidophosphoribosyltransferase  31.98 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0227  amidophosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 445 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3498  amidophosphoribosyltransferase  30.22 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349457  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0334  amidophosphoribosyltransferase  30.72 
 
 		 462 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.708549  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2047  amidophosphoribosyltransferase  30.17 
 
 		 465 aa  78.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.330153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4571  amidophosphoribosyltransferase  31.11 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.470676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0724  amidophosphoribosyltransferase  28.49 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2822  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  34.33 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0522  amidophosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  31.67 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0206  amidophosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6142  amidophosphoribosyltransferase  33.33 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0672  amidophosphoribosyltransferase  32.56 
 
 		 475 aa  77  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.546073  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1130  amidophosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0439  amidophosphoribosyltransferase  30.25 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1152  amidophosphoribosyltransferase  34.16 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0507  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.6 
 
 		 612 aa  76.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00435471 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0708  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  37.93 
 
 		 612 aa  76.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1419  amidophosphoribosyltransferase  31.52 
 
 		 461 aa  76.3  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0127132  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0468  amidophosphoribosyltransferase  29.63 
 
 		 456 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.350158  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2407  amidophosphoribosyltransferase  30.77 
 
 		 487 aa  76.3  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.848054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  32.82 
 
 		 471 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1477  amidophosphoribosyltransferase  34.59 
 
 		 499 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00831  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.8 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0033  amidophosphoribosyltransferase  29.93 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3948  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase  32.14 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.739647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2365  amidophosphoribosyltransferase  32.2 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0824  amidophosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0085  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  29.5 
 
 		 611 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800313  normal  0.506708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  31.33 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3499  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  37.6 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1766  amidophosphoribosyltransferase  30.56 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0501857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2741  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  31.78 
 
 		 611 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.214537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0997  amidophosphoribosyltransferase  27.22 
 
 		 482 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4318  amidophosphoribosyltransferase  31.21 
 
 		 496 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0309  amidophosphoribosyltransferase  30.91 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0292  amidophosphoribosyltransferase  31.13 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.95663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  32.31 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4125  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 		 609 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.513895  normal  0.539293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>