57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0446 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0446  malonate decarboxylase gamma subunit  100 
 
 		 266 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  92.48 
 
 		 266 aa  488  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02590  malonate decarboxylase gamma subunit  73.38 
 
 		 268 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0619996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10320  Malonate decarboxylase gamma subunit  71.86 
 
 		 268 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.056312  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5298  malonate decarboxylase gamma subunit  78.41 
 
 		 261 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.47948  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0296  malonate decarboxylase subunit gamma  72.62 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.526825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2442  malonate decarboxylase, gamma subunit  67.18 
 
 		 263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2879  malonate decarboxylase, gamma subunit  67.56 
 
 		 263 aa  322  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.994306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2608  malonate decarboxylase, gamma subunit  61.98 
 
 		 266 aa  311  6.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0803004  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0950  malonate decarboxylase gamma subunit  63.74 
 
 		 268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1243  malonate decarboxylase, gamma subunit  61.98 
 
 		 267 aa  301  8.000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4929  malonate decarboxylase gamma subunit  58.78 
 
 		 273 aa  290  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.616549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3775  malonate decarboxylase gamma subunit  58.87 
 
 		 266 aa  290  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0108609 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3656  malonate decarboxylase gamma subunit  56.27 
 
 		 264 aa  275  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3867  malonate decarboxylase, gamma subunit  60.15 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4943  malonate decarboxylase, gamma subunit  60.15 
 
 		 276 aa  272  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0583911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5083  malonate decarboxylase, gamma subunit  50.75 
 
 		 272 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.172964  normal  0.178528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1848  putative malonate decarboxylase gamma subunit  51.13 
 
 		 272 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415688  normal  0.0801286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4817  malonate decarboxylase, gamma subunit  49.82 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0587607  normal  0.0256459 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4589  malonate decarboxylase gamma subunit  45.69 
 
 		 280 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1325  hypothetical protein  35.23 
 
 		 297 aa  115  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1060  malonate decarboxylase gamma subunit  35.9 
 
 		 294 aa  116  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0857455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3295  malonate decarboxylase gamma subunit  37.89 
 
 		 294 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1162  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.39 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.166916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3189  malonate decarboxylase, gamma subunit  38.4 
 
 		 245 aa  66.2  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.620399 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0049  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.55 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210818  normal  0.0466048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1150  malonate decarboxylase gamma subunit  31.69 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0170  malonate decarboxylase, gamma subunit  34.25 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.212333  normal  0.869946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6854  malonate decarboxylase, gamma subunit  32.28 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1244  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.99 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58858  normal  0.076268 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1078  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.41 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0076  malonate decarboxylase, gamma subunit  35.9 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0791  malonate decarboxylase gamma subunit  34.78 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0107616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5371  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.07 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278339  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2495  hypothetical protein  27.33 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1272  malonate decarboxylase gamma subunit  32.23 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00955431  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0791  malonate decarboxylase gamma subunit  32.23 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107283  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4415  malonate decarboxylase gamma subunit  31.4 
 
 		 235 aa  62  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.664444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2892  malonate decarboxylase gamma subunit  35.04 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.473236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4017  malonate decarboxylase gamma subunit  35.56 
 
 		 240 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2047  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.69 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2893  malonate decarboxylase gamma subunit  33.33 
 
 		 226 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187079  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0028  malonate decarboxylase, gamma subunit  30.14 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.31944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0027  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.5 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.2409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3154  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.06 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1846  malonate decarboxylase gamma subunit  33.33 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.336793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1143  putative malonate decarboxylase gamma subunit  28.57 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.216529  normal  0.546838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1765  malonate decarboxylase, gamma subunit  31.62 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.928487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4289  malonate decarboxylase gamma subunit  30.33 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.399455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1455  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0490368  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0542  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.960263  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1485  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0611  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.345802  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1259  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.341202  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1585  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.911971  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3034  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.88 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2800  malonate decarboxylase, gamma subunit  33.06 
 
 		 241 aa  46.2  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>