36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1802 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  786    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  89.72 
 
 		 387 aa  706    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  55.9 
 
 		 380 aa  427  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  25.75 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  25.91 
 
 		 354 aa  87  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  26.43 
 
 		 354 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  27.03 
 
 		 354 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  26.73 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  25.08 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  27.21 
 
 		 353 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  26.05 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  23.97 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  26.14 
 
 		 354 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  26.14 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  26.44 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  25.23 
 
 		 354 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  24.6 
 
 		 335 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  29.71 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  23.56 
 
 		 338 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  23.86 
 
 		 345 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  22.69 
 
 		 352 aa  63.9  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  23.71 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  24.91 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  27.27 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  22.83 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  24.03 
 
 		 329 aa  57  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  23.88 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  22.63 
 
 		 338 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  23.08 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  24.73 
 
 		 375 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  23.46 
 
 		 378 aa  54.7  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  22.95 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  24.48 
 
 		 358 aa  50.4  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  24.03 
 
 		 329 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  25.35 
 
 		 374 aa  47.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4530  Peptidase M75, Imelysin  22.28 
 
 		 384 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>