24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1406 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 531 aa  1049    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.155703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1566  hypothetical protein  82.04 
 
 		 539 aa  782    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1929  hypothetical protein  54.55 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000777643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  29.69 
 
 		 927 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  42.11 
 
 		 883 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  41.51 
 
 		 931 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 1057 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  38.6 
 
 		 947 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  38.6 
 
 		 948 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.08 
 
 		 914 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  55 
 
 		 895 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  38.18 
 
 		 946 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  30.47 
 
 		 924 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  53.85 
 
 		 806 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 896 aa  44.3  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  53.85 
 
 		 1115 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  53.85 
 
 		 1124 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  53.85 
 
 		 1129 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  53.85 
 
 		 1110 aa  43.9  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 912 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 911 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  46.15 
 
 		 1359 aa  43.5  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  24.07 
 
 		 1245 aa  43.5  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  38.18 
 
 		 911 aa  43.5  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>