28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1566 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1406  hypothetical protein  80.56 
 
 
531 aa  795    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.155703 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1566  hypothetical protein  100 
 
 
539 aa  1066    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1929  hypothetical protein  54.55 
 
 
372 aa  66.2  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000777643  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  45.61 
 
 
927 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  43.86 
 
 
883 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  40.35 
 
 
947 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  40.35 
 
 
948 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  41.51 
 
 
931 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  35.82 
 
 
1057 aa  48.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  56.41 
 
 
1110 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
896 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  55 
 
 
895 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  44.9 
 
 
924 aa  47  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
911 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
912 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 
911 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  38.18 
 
 
946 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  53.85 
 
 
806 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  37.89 
 
 
888 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  53.85 
 
 
1115 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  53.85 
 
 
1124 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  53.85 
 
 
1129 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  42.55 
 
 
828 aa  44.3  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  46.15 
 
 
1359 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  53.85 
 
 
1147 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  53.85 
 
 
1143 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  53.85 
 
 
1149 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  53.85 
 
 
1148 aa  43.5  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>