More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1591 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2124  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  41.8 
 
 		 785 aa  657    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.168971  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1169  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  46.21 
 
 		 824 aa  716    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.123794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0349  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  47.46 
 
 		 817 aa  746    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.16906  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1498  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  77.26 
 
 		 849 aa  1325    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000296349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2021  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  46.24 
 
 		 824 aa  719    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0655166  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1286  ATP-dependent clp protease ATP-binding subunit  48.66 
 
 		 753 aa  781    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1674  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  48.92 
 
 		 759 aa  747    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.521832 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1347  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  48.41 
 
 		 753 aa  777    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2109  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  47.49 
 
 		 779 aa  749    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0508  ATPase AAA-2  51.1 
 
 		 763 aa  823    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1126  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  46.21 
 
 		 824 aa  714    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.359494  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1677  ATPase AAA-2  77.75 
 
 		 845 aa  1331    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.220039  normal  0.716629 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1591  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  100 
 
 		 854 aa  1745    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0126438  hitchhiker  0.0000548277 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0747  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  45.99 
 
 		 826 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00213324 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1429  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.94 
 
 		 832 aa  725    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.143745  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1932  ATPase  41.06 
 
 		 847 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.356612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  41.31 
 
 		 822 aa  606  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2617  ATPase AAA-2 domain protein  41.32 
 
 		 846 aa  606  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  41.34 
 
 		 854 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0464  ATP-dependent Clp protease  40.94 
 
 		 759 aa  598  1e-170  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.921546  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0567  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  40.41 
 
 		 765 aa  599  1e-170  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.479171  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0255  ATPase AAA-2 domain protein  40.5 
 
 		 849 aa  590  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  40.63 
 
 		 836 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  40.22 
 
 		 839 aa  587  1e-166  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  40.22 
 
 		 835 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  40.28 
 
 		 849 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  40.56 
 
 		 837 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  41.09 
 
 		 792 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  42.15 
 
 		 818 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  40.44 
 
 		 812 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  39.54 
 
 		 848 aa  581  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  40.39 
 
 		 830 aa  580  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  40.22 
 
 		 834 aa  579  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  39.81 
 
 		 866 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  40.61 
 
 		 792 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1902  ATPase  39.23 
 
 		 879 aa  577  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.243846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  39.12 
 
 		 862 aa  575  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  39.98 
 
 		 846 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1079  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  39.62 
 
 		 848 aa  578  1.0000000000000001e-163  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  39.95 
 
 		 825 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  39.4 
 
 		 822 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  40.38 
 
 		 841 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  39.88 
 
 		 842 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.38 
 
 		 824 aa  573  1.0000000000000001e-162  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  39.42 
 
 		 818 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  39.33 
 
 		 854 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  39.09 
 
 		 873 aa  575  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  40.55 
 
 		 825 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  41.58 
 
 		 869 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  39.71 
 
 		 834 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  39.66 
 
 		 842 aa  575  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  40.87 
 
 		 823 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  40.32 
 
 		 853 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000716084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  40.95 
 
 		 852 aa  575  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  40.51 
 
 		 830 aa  572  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  39.29 
 
 		 822 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  40.56 
 
 		 862 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1370  ATPase AAA-2 domain protein  40.31 
 
 		 843 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0603  ATPase AAA-2 domain protein  40.38 
 
 		 852 aa  572  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0740742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  39.66 
 
 		 841 aa  570  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  37.9 
 
 		 874 aa  572  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  40.53 
 
 		 812 aa  569  1e-161  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  38.56 
 
 		 855 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  39.98 
 
 		 823 aa  572  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  40.29 
 
 		 821 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3951  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  39.84 
 
 		 868 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1039  ATPase  38.91 
 
 		 873 aa  570  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.924654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  39.25 
 
 		 855 aa  570  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  39.81 
 
 		 812 aa  570  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  39.51 
 
 		 852 aa  571  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1002  ATP-dependent chaperone ClpB  38.95 
 
 		 859 aa  570  1e-161  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  40.43 
 
 		 814 aa  572  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  40.1 
 
 		 814 aa  569  1e-161  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  38.68 
 
 		 855 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0617  chaperone protein clpB  39.13 
 
 		 871 aa  570  1e-161  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.995797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  39.29 
 
 		 843 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  39.59 
 
 		 829 aa  568  1e-160  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0363  ATPase  40.61 
 
 		 830 aa  568  1e-160  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0571642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3164  ATPase  39.09 
 
 		 857 aa  568  1e-160  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.311114  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  40.24 
 
 		 816 aa  566  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  40.07 
 
 		 810 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1797  ATP-dependent chaperone ClpB  37.9 
 
 		 931 aa  569  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.287163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  39.42 
 
 		 846 aa  568  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1402  ATPase AAA-2 domain protein  40.28 
 
 		 819 aa  567  1e-160  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.515013  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  40.93 
 
 		 834 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0367  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  38.72 
 
 		 857 aa  568  1e-160  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  41.82 
 
 		 820 aa  567  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.8 
 
 		 879 aa  568  1e-160  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1132  ATPase AAA-2 domain protein  39.27 
 
 		 846 aa  567  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.502514  normal  0.57149 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  38.54 
 
 		 859 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  39.55 
 
 		 825 aa  568  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  40.17 
 
 		 858 aa  567  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  39.42 
 
 		 822 aa  566  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60190  clpB protein  39.31 
 
 		 854 aa  568  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00250267  hitchhiker  0.00000000231015 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  40.02 
 
 		 861 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0494  ATP-dependent chaperone ClpB  38.2 
 
 		 846 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0216  chaperone ClpB  39.06 
 
 		 866 aa  567  1e-160  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  39.04 
 
 		 874 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2746  protein disaggregation chaperone  38.5 
 
 		 857 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00462147  normal  0.181562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  39.35 
 
 		 814 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>