More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1417 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1417  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  524  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1822  ABC methionine transporter, ATPase subunit MetN  75.78 
 
 		 256 aa  403  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.876505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2105  ABC transporter related  74.61 
 
 		 256 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4598  ABC transporter related  59.73 
 
 		 293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.524131 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1503  ABC transporter related protein  53.25 
 
 		 350 aa  266  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3788  ABC transporter related  56.22 
 
 		 290 aa  261  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3652  ABC transporter related  54.27 
 
 		 339 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23470  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  54.55 
 
 		 349 aa  253  2.0000000000000002e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00129815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0973  ABC transporter related  53.25 
 
 		 338 aa  253  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3079  ABC transporter related protein  53.04 
 
 		 342 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2298  ABC transporter related  51.95 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0385  ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0341  ABC transporter, ATP-binding protein  51.95 
 
 		 339 aa  249  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2430  hypothetical protein  54.25 
 
 		 345 aa  248  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0121441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0358  ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 		 339 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1681  ABC transporter related  52.81 
 
 		 338 aa  248  7e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000123006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4962  ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 		 339 aa  248  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0297  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0281  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 339 aa  247  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0292  ABC transporter related  51.08 
 
 		 339 aa  247  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0312  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0343  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 339 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2926  ABC transporter related  52.17 
 
 		 342 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000015869  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0284  ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 		 339 aa  246  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2100  ABC transporter related  52.48 
 
 		 347 aa  246  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.182492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2245  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.8 
 
 		 385 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0698  metal ion ABC transporter ATPase  51.49 
 
 		 401 aa  246  4e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1769  ABC transporter related  51.12 
 
 		 344 aa  245  4e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000333241  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1487  ABC transporter related  51.56 
 
 		 340 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000017469  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1650  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.39 
 
 		 344 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2301  ABC transporter related  51.95 
 
 		 392 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  53.37 
 
 		 339 aa  245  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0861  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.99 
 
 		 349 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.232562  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.867435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0414  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2980  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0215  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0131  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2931  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5114  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 335 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.182422  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2558  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0934  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2870  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0805  ABC transporter related protein  52.99 
 
 		 322 aa  244  9e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.63859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0759  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.39 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04690  ABC-type metal ion transport system, ATPase component  52.4 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0790  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.99 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264335  normal  0.409094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2398  ABC transporter related  51.52 
 
 		 338 aa  243  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2988  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.16 
 
 		 344 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.550247  hitchhiker  0.00296949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1771  ABC transporter related  51.74 
 
 		 340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237525  hitchhiker  0.000187341 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  53.95 
 
 		 347 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3986  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.63 
 
 		 343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0935  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.39 
 
 		 344 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1096  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000220357  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0129  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49 
 
 		 335 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131021 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0250  ABC transporter related protein  56.1 
 
 		 400 aa  241  7.999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0580  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.300402  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1059  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 		 385 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1018  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 		 344 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0619  methionine import ATP-binding protein MetN 2  51.52 
 
 		 338 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0560  methionine import ATP-binding protein MetN 2  51.52 
 
 		 338 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0558  methionine import ATP-binding protein MetN 2  51.52 
 
 		 338 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2221  ABC transporter related  51.74 
 
 		 340 aa  239  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0565  methionine import ATP-binding protein MetN 2  51.52 
 
 		 338 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2652  ABC transporter related  51.92 
 
 		 340 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3485  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.22 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0920  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.34 
 
 		 350 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.539621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0575  methionine import ATP-binding protein MetN 2  51.52 
 
 		 338 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.351467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4172  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.781042  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3342  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.44 
 
 		 343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000749199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4809  ABC transporter related  52.38 
 
 		 341 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00917748  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3499  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52.44 
 
 		 343 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00014071  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0939  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.446687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1043  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3405  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.56 
 
 		 343 aa  239  4e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0164729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0734  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.98 
 
 		 344 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.260825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0111  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5125  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000057454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4855  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.248065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4711  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0281  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  49.4 
 
 		 335 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5222  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0353533  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5127  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000360492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5092  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3248  D-methionine ABC transporter, ATP-binding protein  52.16 
 
 		 320 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0847  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  51.56 
 
 		 343 aa  236  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000211162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4696  ABC transporter, ATP-binding protein  51.52 
 
 		 341 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000324387  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1395  ABC transporter related  55.45 
 
 		 337 aa  236  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5129  ABC transporter, ATP-binding protein  51.08 
 
 		 397 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2536  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  48.72 
 
 		 352 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0300192  normal  0.239692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2457  ABC transporter related  50.42 
 
 		 368 aa  236  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3753  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.67 
 
 		 343 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000257186  normal  0.0826267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2534  ABC transporter related protein  50.87 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0878  D-methionine ABC transporter, ATPase subunit  52 
 
 		 343 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000103335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2367  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.13 
 
 		 359 aa  235  4e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0612638  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0886  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  50.43 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2553  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  47.76 
 
 		 344 aa  235  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1797  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  51.98 
 
 		 341 aa  235  6e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0285  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52 
 
 		 343 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00936615  normal  0.383177 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0274  DL-methionine transporter ATP-binding subunit  52 
 
 		 343 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0116933  normal  0.0903375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>