39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0948 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0909  hypothetical protein  99.72 
 
 		 354 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0948  periplasmic lipoprotein-like protein  100 
 
 		 354 aa  717    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0977  lipoprotein  93.22 
 
 		 354 aa  671    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00313194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4477  lipoprotein  95.76 
 
 		 354 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.24024  normal  0.364663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4490  putative lipoprotein  81.07 
 
 		 354 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56850  putative lipoprotein  74.08 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4941  putative lipoprotein  74.08 
 
 		 354 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4064  putative lipoprotein  77.12 
 
 		 354 aa  518  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82498  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4368  lipoprotein, putative  76.55 
 
 		 354 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3297  periplasmic lipoprotein-like protein  59.71 
 
 		 353 aa  418  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37860  hypothetical protein  58.47 
 
 		 354 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214112  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2835  periplasmic lipoprotein  28.97 
 
 		 344 aa  133  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3527  putative signal peptide protein  27.67 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793517  normal  0.789193 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1784  putative lipoprotein  28.09 
 
 		 339 aa  122  8e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.327643  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003125  iron-regulated protein A precursor  29.77 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.392653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02712  hypothetical protein  29.77 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0885  putative lipoprotein  29.43 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1370  hypothetical protein  30.17 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.378457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4313  hypothetical protein  24.39 
 
 		 366 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4576  hypothetical protein  25.3 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0477994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  25.37 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2203  hypothetical protein  26.44 
 
 		 342 aa  92.4  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0565  hypothetical protein  28.45 
 
 		 338 aa  87.8  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2559  periplasmic lipoprotein-like protein  26.88 
 
 		 352 aa  86.7  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0351138  hitchhiker  0.00000000167803 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2084  hypothetical protein  25.23 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0195  putative signal peptide protein  27.76 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.533491  normal  0.303405 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1802  hypothetical protein  26.14 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0641  hypothetical protein  25.48 
 
 		 358 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1544  signal peptide protein  27.46 
 
 		 329 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3870  Peptidase M75, Imelysin  24.36 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.755425  normal  0.516703 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3024  periplasmic lipoprotein-like protein  29.27 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00846426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3194  hypothetical protein  26.71 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967593  normal  0.475895 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2143  periplasmic lipoprotein-like protein  25 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0403933 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1527  periplasmic lipoprotein-like protein  25.32 
 
 		 361 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.75 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0668  hypothetical protein  19.72 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0864322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2563  periplasmic lipoprotein-like protein  26.83 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.440484  hitchhiker  0.00108015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0805  periplasmic lipoprotein-like protein  22.7 
 
 		 355 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1923  periplasmic lipoprotein-like protein  23.68 
 
 		 375 aa  42.7  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.576984  hitchhiker  0.00344401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>