205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4430 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4430  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0758  hypothetical protein  92.72 
 
 		 206 aa  394  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0786  hypothetical protein  92.72 
 
 		 206 aa  393  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0800  hypothetical protein  92.68 
 
 		 206 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.72478 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4716  hypothetical protein  81.16 
 
 		 207 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0983  hypothetical protein  72.46 
 
 		 209 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.015485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1143  hypothetical protein  71.01 
 
 		 209 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41280  hypothetical protein  70.39 
 
 		 205 aa  288  3e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5280  hypothetical protein  69.42 
 
 		 204 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.191722  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61320  hypothetical protein  68.93 
 
 		 204 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.681363 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3670  hypothetical protein  65.05 
 
 		 205 aa  264  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  38.64 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  38.12 
 
 		 248 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.48 
 
 		 238 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  35.32 
 
 		 222 aa  121  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  35.56 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  34.39 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  36.02 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  38.22 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  36.44 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  35.59 
 
 		 224 aa  115  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  32.59 
 
 		 235 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  34.39 
 
 		 222 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  35.51 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  33.79 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1038  hypothetical protein  33.79 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1003  hypothetical protein  33.79 
 
 		 222 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  31.36 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  35.71 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  31.95 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  36.89 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1957  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  32.93 
 
 		 251 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  32.42 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  32.74 
 
 		 226 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  33.95 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  31.82 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  35.27 
 
 		 262 aa  101  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  33.95 
 
 		 243 aa  101  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  30.74 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  33.03 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  34.04 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  38.54 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  33.49 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  36.72 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2836  protein of unknown function DUF159  34.25 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.195669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30.49 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  34.5 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.26 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  32.88 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  33.2 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3713  hypothetical protein  35.96 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3022  hypothetical protein  37.29 
 
 		 223 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.310509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2598  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 		 290 aa  99  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.107736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  33.9 
 
 		 259 aa  98.2  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  33.52 
 
 		 254 aa  97.8  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  28.51 
 
 		 234 aa  97.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  33.52 
 
 		 255 aa  96.7  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  31.84 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.48 
 
 		 231 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  32.64 
 
 		 254 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  33.9 
 
 		 241 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  28.12 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  28.17 
 
 		 255 aa  94.7  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2616  protein of unknown function DUF159  31.46 
 
 		 220 aa  94.4  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.163016 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  29.28 
 
 		 225 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  34.07 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  31.95 
 
 		 253 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.14 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  31.98 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  31.02 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  30.25 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  33.06 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.87 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  32.61 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  35.12 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  33.48 
 
 		 242 aa  92  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  91.7  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  34.34 
 
 		 254 aa  91.3  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  31.4 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  34.86 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  33.33 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  37.28 
 
 		 240 aa  90.1  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  34.84 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  31.01 
 
 		 261 aa  90.1  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  31.55 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  37.8 
 
 		 238 aa  89.4  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  32.95 
 
 		 247 aa  89  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  30.15 
 
 		 281 aa  89.4  4e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  31.53 
 
 		 222 aa  88.6  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  28.63 
 
 		 223 aa  88.6  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  26.36 
 
 		 261 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  30.04 
 
 		 254 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  33.16 
 
 		 219 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  26.22 
 
 		 226 aa  87  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  31.56 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>