More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3058 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3058  ATPase  100 
 
 		 324 aa  654    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  67.3 
 
 		 319 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3113  putative MoxR-like ATPase  57.59 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.70365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  56.62 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.94 
 
 		 325 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3798  ATPase  58.57 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2891  ATPase  57.1 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.106525  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  54.66 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1736  ATPase  53.82 
 
 		 320 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  55.1 
 
 		 318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1201  ATPase  55.59 
 
 		 325 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  51.7 
 
 		 331 aa  352  7e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  53.16 
 
 		 318 aa  351  8e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  51.7 
 
 		 331 aa  351  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  51.24 
 
 		 321 aa  348  6e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  53.46 
 
 		 318 aa  348  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  53.42 
 
 		 319 aa  346  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  53.42 
 
 		 319 aa  345  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0527  conserved hypothetical protein, putative ATPase  53.65 
 
 		 318 aa  344  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3208  ATPase  52.48 
 
 		 319 aa  343  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1103  MoxR-related protein  52.98 
 
 		 318 aa  343  2e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001272  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  51.58 
 
 		 318 aa  343  2e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.798061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000309  MoxR-like ATPase in aerotolerance operon  52.81 
 
 		 327 aa  343  2.9999999999999997e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  52.16 
 
 		 320 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2070  hypothetical protein  53.48 
 
 		 326 aa  341  9e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  52.34 
 
 		 347 aa  341  1e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24430  hypothetical protein  53.31 
 
 		 326 aa  340  1e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0564  ATPase  55.69 
 
 		 333 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3559  ubiquinol--cytochrome-c reductase  55.45 
 
 		 333 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.389253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1564  ATPase  52.48 
 
 		 319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2032  ATPase, putative  52.48 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.54515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3389  ATPase  55.45 
 
 		 333 aa  339  4e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3710  ATPase  52.48 
 
 		 319 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3159  hypothetical protein  50.76 
 
 		 333 aa  338  9.999999999999999e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.317083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  52.32 
 
 		 319 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18830  AAA superfamily ATPase, MoxR-like protein  52.17 
 
 		 319 aa  334  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.0000478732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  51.9 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  51.25 
 
 		 319 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  53.59 
 
 		 318 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  51.58 
 
 		 335 aa  329  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  51.9 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  51.9 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  51.9 
 
 		 318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  51.27 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  51.27 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.27 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  51.27 
 
 		 318 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50.95 
 
 		 318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2929  ATPase  51.7 
 
 		 319 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  51.58 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0076  ATPase  51.27 
 
 		 323 aa  325  6e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00279376  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  50.48 
 
 		 318 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2169  MoxR domain-containing protein  50.79 
 
 		 318 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.351937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3235  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.47 
 
 		 356 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  48.9 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  50.32 
 
 		 318 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02348  methanol dehydrogenase regulatory protein  47.99 
 
 		 339 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0849  ATPase  52.4 
 
 		 324 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0895498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.08 
 
 		 350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1736  ATPase  49.06 
 
 		 322 aa  300  3e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.757326 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.34 
 
 		 329 aa  293  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  45.6 
 
 		 331 aa  292  5e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0184  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.39 
 
 		 322 aa  291  2e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.914091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.22 
 
 		 324 aa  289  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  44.52 
 
 		 330 aa  288  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  45.1 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0176  putative ATPase family associated with various cellular activities (AAA)  46.27 
 
 		 330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.55 
 
 		 325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.51 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.3 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  42.45 
 
 		 333 aa  282  5.000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  42.5 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  44.98 
 
 		 335 aa  278  7e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  43.32 
 
 		 334 aa  278  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.16 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.57 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.08 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.63 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  44.83 
 
 		 327 aa  275  6e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  41.69 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  47.81 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  44.41 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.02 
 
 		 353 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.49 
 
 		 329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.65 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.81 
 
 		 333 aa  272  5.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  46.15 
 
 		 339 aa  272  5.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  43.53 
 
 		 340 aa  272  6e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.37 
 
 		 318 aa  272  7e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  43.71 
 
 		 332 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  45.23 
 
 		 344 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  44.27 
 
 		 337 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0095  ATPase  42.11 
 
 		 329 aa  269  5e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.204442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.45 
 
 		 432 aa  269  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.21 
 
 		 329 aa  268  8.999999999999999e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.81 
 
 		 332 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.84 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.21 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  43.59 
 
 		 319 aa  265  5e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  43.69 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>