21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2224 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2224  amine dehydrogenase  100 
 
 		 383 aa  784    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4472  amine dehydrogenase  38.44 
 
 		 385 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5222  amine dehydrogenase  38.38 
 
 		 385 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3580  amine dehydrogenase  37.67 
 
 		 385 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643394  normal  0.58903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0601  amine dehydrogenase  37.54 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4997  amine dehydrogenase  37.05 
 
 		 385 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3305  amine dehydrogenase  37.54 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5062  amine dehydrogenase  37.54 
 
 		 385 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3809  amine dehydrogenase  35.6 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.623781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0160  amine dehydrogenase  36.13 
 
 		 383 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4080  amine dehydrogenase  33.52 
 
 		 401 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.655857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0557  amine dehydrogenase  33.88 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3254  amine dehydrogenase  34.59 
 
 		 385 aa  179  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000080765  decreased coverage  0.00024338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4363  methylamine dehydrogenase heavy subunit  33.22 
 
 		 387 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0035  Amine dehydrogenase  31.98 
 
 		 408 aa  173  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137586  normal  0.0109788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1685  amine dehydrogenase  32.69 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.664981  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3818  methylamine dehydrogenase heavy subunit  31.83 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.55568  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2335  Amine dehydrogenase  34.84 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0565  methylamine dehydrogenase heavy chain  26.74 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4730  methylamine dehydrogenase heavy chain  28.39 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0932481  normal  0.201487 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0548  amine dehydrogenase  26.88 
 
 		 400 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0316966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>