13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1464 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1464  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  986    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.196892  normal  0.619113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3826  hypothetical protein  34.88 
 
 		 485 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2035  hypothetical protein  33.82 
 
 		 512 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.045706  normal  0.2483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1488  hypothetical protein  32.27 
 
 		 488 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2226  hypothetical protein  32.2 
 
 		 515 aa  172  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148711  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1879  hypothetical protein  28.54 
 
 		 504 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.363946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1883  hypothetical protein  28.44 
 
 		 635 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.393139  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3828  hypothetical protein  24.17 
 
 		 669 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2041  hypothetical protein  25 
 
 		 1430 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.153705 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2033  hypothetical protein  27.48 
 
 		 692 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.68531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3832  hypothetical protein  26.4 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1462  hypothetical protein  26.67 
 
 		 592 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0152709  normal  0.836043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1881  hypothetical protein  25 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.393635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>