33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2708 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3422  hypothetical protein  68.1 
 
 		 558 aa  781    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000443439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2708  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1119    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1091  hypothetical protein  54.63 
 
 		 552 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000808246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2491  hypothetical protein  44.5 
 
 		 552 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1727  hypothetical protein  44.35 
 
 		 551 aa  473  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3838  hypothetical protein  33.02 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.131459  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45100  hypothetical protein  32.5 
 
 		 551 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4465  hypothetical protein  31.21 
 
 		 545 aa  262  2e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2320  putative mucoidy inhibitor A  29.64 
 
 		 548 aa  210  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0480516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0319  mucoidy inhibitor-like protein  23.7 
 
 		 538 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.623253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1827  hypothetical protein  25.51 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120538  normal  0.954748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6526  hypothetical protein  25.63 
 
 		 578 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.122318 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2776  hypothetical protein  24.87 
 
 		 545 aa  127  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3460  hypothetical protein  25.7 
 
 		 547 aa  126  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3625  hypothetical protein  25.38 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0431  hypothetical protein  26.51 
 
 		 586 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2089  hypothetical protein  23.29 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1973  hypothetical protein  25.32 
 
 		 525 aa  101  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.788062  normal  0.0901572 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3125  hypothetical protein  27.89 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0710  hypothetical protein  22.14 
 
 		 550 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1025  hypothetical protein  21.43 
 
 		 509 aa  95.1  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1642  hypothetical protein  25.51 
 
 		 492 aa  93.6  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.44937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1378  hypothetical protein  26.05 
 
 		 477 aa  89.7  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1732  hypothetical protein  26.69 
 
 		 624 aa  86.7  9e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2628  hypothetical protein  22.77 
 
 		 591 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2312  hypothetical protein  21.12 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2328  hypothetical protein  25.24 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0113  hypothetical protein  22.5 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1972  hypothetical protein  44.09 
 
 		 788 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.2775 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0802  hypothetical protein  30.28 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00695722  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2671  hypothetical protein  23.59 
 
 		 649 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0148077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0829  hypothetical protein  28.36 
 
 		 461 aa  51.6  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000679241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1138  hypothetical protein  23.94 
 
 		 536 aa  51.2  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.119813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>