34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0915 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2655  hypothetical protein  29.17 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 		 615 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 568 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03840  hypothetical protein  30.61 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189773  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.84 
 
 		 565 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.43 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  32.65 
 
 		 124 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  30.77 
 
 		 120 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 570 aa  43.9  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 562 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  30.39 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  32.41 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0479  acyl carrier protein dehydratase-like protein  35.71 
 
 		 108 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  32.41 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.97 
 
 		 565 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1462  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.88 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  32.41 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  27.63 
 
 		 609 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  26.87 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0342  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.29 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000163743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.55 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2798  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  30.36 
 
 		 142 aa  42  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673161  normal  0.655992 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  29.51 
 
 		 609 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  29.41 
 
 		 134 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1081  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  31.88 
 
 		 123 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  29.41 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  29.41 
 
 		 134 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0663  beta-hydroxyacyl-[acyl carrier protein] dehydratase FabZ  26.05 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  30.99 
 
 		 584 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.25 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 593 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3020  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.49 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000176008  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  30.34 
 
 		 122 aa  40  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>