19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2069 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  57.47 
 
 		 221 aa  256  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  53.98 
 
 		 226 aa  224  6e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.98 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  44.89 
 
 		 230 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  35.16 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  33.97 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.05 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  28.34 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.68 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  26.26 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  23.5 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  21.61 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 264 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4341  Zinc finger-domain-containing protein  30.33 
 
 		 479 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75184  normal  0.874697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  31.67 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>