More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_2033 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  100 
 
 
472 aa  964    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1751  serine/threonine protein kinase  92.06 
 
 
214 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.868443  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 
469 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  43.36 
 
 
465 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  44.85 
 
 
466 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  44.64 
 
 
466 aa  395  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4274  serine/threonine protein kinase  41.59 
 
 
481 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.700711  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  39.83 
 
 
481 aa  362  6e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0471  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
479 aa  355  1e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0480  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
479 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172834  normal  0.0196518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0911  serine/threonine protein kinase  39.13 
 
 
479 aa  335  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5336  serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
485 aa  325  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.567075 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3032  serine/threonine protein kinase  38.43 
 
 
483 aa  323  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.438769  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0617  serine/threonine protein kinase protein  35.95 
 
 
469 aa  322  9.000000000000001e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1867  serine/threonine protein kinase  38.21 
 
 
479 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.133494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1490  serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 
479 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3809  serine/threonine protein kinase  35.56 
 
 
478 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3860  serine/threonine protein kinase  37.61 
 
 
486 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.585688 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  30.38 
 
 
692 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  34.09 
 
 
618 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
691 aa  146  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.59 
 
 
641 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34 
 
 
650 aa  144  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
615 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  32.22 
 
 
651 aa  140  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.44 
 
 
715 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.26 
 
 
584 aa  139  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0821  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.89 
 
 
525 aa  139  8.999999999999999e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  31.32 
 
 
638 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  33.46 
 
 
612 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.32 
 
 
627 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.72 
 
 
662 aa  139  1e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.48 
 
 
863 aa  139  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3539  protein kinase  33.09 
 
 
403 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0867944  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  32.45 
 
 
667 aa  137  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4436  serine/threonine protein kinase  32.45 
 
 
691 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0627175  normal  0.401092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.37 
 
 
681 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  29 
 
 
325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  30.94 
 
 
635 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  32.95 
 
 
666 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  30.19 
 
 
692 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.64 
 
 
880 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.52 
 
 
747 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.25 
 
 
613 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  31.14 
 
 
703 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
612 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  32.44 
 
 
700 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.6 
 
 
598 aa  133  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  32.06 
 
 
598 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0729  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
464 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.44074  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  30.45 
 
 
582 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  30.89 
 
 
593 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  31.11 
 
 
636 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3283  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
398 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
664 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2811  serine/threonine kinase protein  29.89 
 
 
1057 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  30.43 
 
 
1053 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  29.28 
 
 
624 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
691 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 
569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  29.27 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  31.75 
 
 
889 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0022  protein kinase  31.32 
 
 
597 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  30.77 
 
 
625 aa  128  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.07 
 
 
645 aa  128  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
562 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.91 
 
 
579 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  29.41 
 
 
621 aa  128  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
328 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  29.63 
 
 
625 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.89 
 
 
591 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  29.81 
 
 
625 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  36.29 
 
 
678 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 
502 aa  127  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.63 
 
 
661 aa  126  7e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  28.53 
 
 
626 aa  126  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.02 
 
 
594 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3272  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
398 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3334  serine/threonine protein kinase  31.44 
 
 
398 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.502424  normal  0.33642 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0025  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.63 
 
 
668 aa  126  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  37.09 
 
 
571 aa  126  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  28.92 
 
 
556 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 
520 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.34 
 
 
632 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  34.43 
 
 
599 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.81 
 
 
647 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  28.68 
 
 
662 aa  125  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  29.76 
 
 
571 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  30.1 
 
 
571 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.69 
 
 
681 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.48 
 
 
668 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4878  serine/threonine protein kinase  32.13 
 
 
622 aa  124  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.160783  normal  0.181716 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  31.78 
 
 
604 aa  124  4e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  29.17 
 
 
556 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.26 
 
 
627 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  29.5 
 
 
632 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  31.15 
 
 
634 aa  123  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0023  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
746 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>