More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1947 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1947  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 		 137 aa  269  7e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1652  Rhodanese domain protein  79.56 
 
 		 137 aa  219  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.964264 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2773  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0447  rhodanese domain-containing protein  49.28 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.185748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  48.18 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2911  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  47.45 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2242  rhodanese-like protein  49.28 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98062  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2856  rhodanese domain-containing protein  49.28 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2867  rhodanese domain-containing protein  49.28 
 
 		 140 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6185  rhodanese-like protein  48.55 
 
 		 140 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2839  rhodanese-like domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3207  rhodanese-like domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1412  rhodanese-like domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0663  rhodanese-like domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0417  rhodanese-like domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.764861  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0180  rhodanese-like domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0498  rhodanese domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0479  rhodanese domain-containing protein  46.72 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0267  rhodanese domain-containing protein  43.8 
 
 		 161 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.968437  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0354  hypothetical protein  38.57 
 
 		 151 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.842496  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0305  rhodanese-like protein  40.88 
 
 		 137 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0229  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.479162  hitchhiker  0.0025446 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  38.69 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0210  Rhodanese domain protein  37.86 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.158606 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  40.29 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  35.66 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3857  rhodanese domain-containing protein  37.23 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.848576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0717  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0134  Rhodanese domain protein  39.23 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.410653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0887  rhodanese-like protein  36.5 
 
 		 136 aa  79.3  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.726229  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0039  rhodanese domain-containing protein  36.5 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.861184  normal  0.831321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1814  rhodanese domain-containing protein  36.43 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.315882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1122  rhodanese-like protein  36.64 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4102  Rhodanese domain protein  37.12 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25625  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1310  rhodanese-like protein  34.31 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.649013  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2827  Rhodanese domain protein  36.5 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03971  hypothetical protein  37.69 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3612  rhodanese-like protein  34.55 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.588144  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0928  rhodanese domain-containing protein  34.92 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.585499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  32.62 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2228  hypothetical protein  38.24 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4818  rhodanese domain-containing protein  35 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.355939  hitchhiker  0.000187411 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  32.26 
 
 		 142 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0714  putative transmembrane protein  30.71 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.274241  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0050  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2803  hypothetical protein  30.66 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3515  rhodanese domain-containing protein  32.82 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0047  rhodanese-like protein  32.04 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0044  rhodanese domain-containing protein  32.56 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4216  rhodanese domain-containing protein  31.01 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0052  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103873 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0041  rhodanese domain-containing protein  31.54 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3210  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.307395 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  29.93 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3921  rhodanese domain protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3983  rhodanese domain protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1131  rhodanese domain-containing protein  35.85 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00783742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3697  rhodanese-like protein  31.01 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4028  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3902  rhodanese domain protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.186637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0046  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4089  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0076  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4140  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.585965  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0070  rhodanese domain-containing protein  29.71 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4020  rhodanese domain-containing protein  30.23 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  39.8 
 
 		 278 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0061  rhodanese-like protein  31.78 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3504  rhodanese domain-containing protein  35.77 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3805  rhodanese domain-containing protein  31.11 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.715987 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  31.52 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  31.52 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0463  rhodanese-related sulfurtransferase  31.01 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1704  putative sulfurtransferase  31.01 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03469  predicted rhodanese-related sulfurtransferase  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0094  Rhodanese domain protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0097  rhodanese domain-containing protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4039  rhodanese domain protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4984  rhodanese domain protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0124  rhodanese domain-containing protein  34.11 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3948  rhodanese domain-containing protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.848224 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4115  rhodanese domain-containing protein  33.59 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03420  hypothetical protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3823  rhodanese domain-containing protein  34.35 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2623  Rhodanese domain protein  35.51 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0044  rhodanese domain-containing protein  34.69 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2254  hypothetical protein  29.6 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2225  hypothetical protein  29.6 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4876  rhodanese domain-containing protein  31.78 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4083  Rhodanese domain protein  30.71 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002246  rhodanese-related sulfurtransferase  31.73 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.566025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0048  rhodanese domain-containing protein  33.67 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000123958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4364  Rhodanese domain protein  30 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00122  sulfurtransferase  32.69 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4390  rhodanese domain-containing protein  24.81 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  32.22 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3941  Rhodanese domain protein  32.14 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4842  beta-lactamase-like  34.94 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4928  rhodanese domain-containing protein  33.65 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.84511  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>