24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4345 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4345  hypothetical protein  100 
 
 
348 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.453568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3667  hypothetical protein  42.94 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4769  hypothetical protein  30.95 
 
 
350 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5577  hypothetical protein  30.14 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6538  hypothetical protein  30.03 
 
 
334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21958  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2217  hypothetical protein  28.37 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1600  hypothetical protein  28.49 
 
 
343 aa  105  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2530  hypothetical protein  28.03 
 
 
354 aa  102  8e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000232109  normal  0.208173 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5220  hypothetical protein  26.69 
 
 
332 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4268  hypothetical protein  28.57 
 
 
355 aa  97.1  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.023455  normal  0.841882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1555  hypothetical protein  26.76 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4487  hypothetical protein  25.43 
 
 
369 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5434  hypothetical protein  25.56 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.406092 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6275  hypothetical protein  27.51 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0198  hypothetical protein  28.93 
 
 
327 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000049437 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4960  hypothetical protein  27.05 
 
 
394 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.763146 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0345  hypothetical protein  27.08 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.905049  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1323  hypothetical protein  26.35 
 
 
313 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.506498  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2354  hypothetical protein  21.26 
 
 
376 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1997  hypothetical protein  23.08 
 
 
384 aa  48.9  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1616  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3948  hypothetical protein  20.52 
 
 
351 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  0.516752 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0733  hypothetical protein  21.43 
 
 
342 aa  47  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2523  hypothetical protein  20.35 
 
 
317 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1191  hypothetical protein  24.58 
 
 
338 aa  45.4  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>