More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3718 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012792  Vapar_6284  NAD+ synthetase  76.99 
 
 
566 aa  877    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5607  NAD+ synthetase  68.37 
 
 
566 aa  715    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.44805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0975  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  69.38 
 
 
566 aa  739    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212633  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3718  NAD+ synthetase  100 
 
 
566 aa  1149    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0770195  normal  0.014642 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  39.49 
 
 
561 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  39.66 
 
 
561 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  40.77 
 
 
543 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  40.07 
 
 
566 aa  396  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  42.03 
 
 
567 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  39.75 
 
 
567 aa  396  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3217  NAD+ synthetase  40.14 
 
 
557 aa  394  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0217  NAD+ synthetase  41.61 
 
 
554 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2312  NAD+ synthetase  41.23 
 
 
571 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.589478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2239  NAD synthetase  42.48 
 
 
558 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.572998 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  38.79 
 
 
561 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  38.97 
 
 
561 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2091  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.93 
 
 
550 aa  388  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0411  NAD+ synthetase  38.34 
 
 
546 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.172115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.47 
 
 
556 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  40.95 
 
 
556 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  36.87 
 
 
574 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  38.65 
 
 
584 aa  382  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0150  NAD+ synthetase  41.37 
 
 
543 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3277  NAD+ synthetase  39.06 
 
 
554 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  41.18 
 
 
540 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  37.05 
 
 
560 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  39.29 
 
 
577 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  39.54 
 
 
542 aa  369  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1154  NAD synthetase  39.01 
 
 
540 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3630  NAD synthetase  38.83 
 
 
540 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1261  NAD synthetase  39.01 
 
 
540 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.143958  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15651  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  38.24 
 
 
576 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.873266  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1036  NAD+ synthetase  39.51 
 
 
558 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.29 
 
 
566 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  39.37 
 
 
542 aa  366  1e-100  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0495  NAD+ synthase  39.45 
 
 
558 aa  365  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2180  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  40.55 
 
 
561 aa  368  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.432565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3650  NAD synthetase  38.65 
 
 
540 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04891  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  40.68 
 
 
564 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  37.95 
 
 
566 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0426  NAD+ synthetase  39.37 
 
 
548 aa  365  1e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.277898  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  37.27 
 
 
576 aa  365  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2360  NAD+ synthetase  39.59 
 
 
564 aa  364  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.869499  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  37.27 
 
 
576 aa  363  4e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0307  NAD+ synthetase  41.54 
 
 
569 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.770204  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  37.17 
 
 
583 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  38.08 
 
 
552 aa  362  1e-98  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  36.82 
 
 
566 aa  361  2e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0449  NAD+ synthetase  39.76 
 
 
556 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.270974 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  39.96 
 
 
554 aa  360  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1566  NAD synthetase  39.76 
 
 
560 aa  359  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175024  normal  0.0652771 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16481  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  35.54 
 
 
565 aa  359  8e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0285  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  41.19 
 
 
569 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.210766  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1539  NAD+ synthetase  35.9 
 
 
565 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4875  NAD+ synthetase  40.38 
 
 
559 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0223  NAD+ synthetase  37.11 
 
 
540 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0977  NAD+ synthase  37.93 
 
 
569 aa  356  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  40.17 
 
 
577 aa  356  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  38.91 
 
 
545 aa  355  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16361  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  35.73 
 
 
565 aa  355  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0572  NAD+ synthetase  39.51 
 
 
552 aa  353  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.323116  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  34.39 
 
 
575 aa  354  2.9999999999999997e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0981  NAD synthetase  38.85 
 
 
550 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1015  NAD synthetase  38.85 
 
 
550 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.52427  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16251  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  35.84 
 
 
565 aa  353  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0296  NAD+ synthetase  41.01 
 
 
569 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  36.61 
 
 
567 aa  352  8e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18451  carbon-nitrogen hydrolase:NAD+ synthase  37.76 
 
 
569 aa  352  1e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.522379 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  36.61 
 
 
567 aa  351  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0105  NAD synthetase  39.97 
 
 
574 aa  349  6e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.1435  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2221  NAD synthetase  37.8 
 
 
559 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.355506 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  37.89 
 
 
559 aa  349  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0811  NAD+ synthetase  38.53 
 
 
546 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1709  NAD+ synthetase  38.79 
 
 
565 aa  347  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2097  NAD synthetase  38.33 
 
 
559 aa  346  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.285667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  34.78 
 
 
573 aa  346  8e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1699  NAD+ synthetase  39.05 
 
 
561 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100102  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  39.93 
 
 
538 aa  345  2e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2549  NAD+ synthetase  38.94 
 
 
541 aa  344  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.402405  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  36.96 
 
 
577 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1463  NAD synthetase  38.97 
 
 
572 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00661124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2113  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.54 
 
 
559 aa  343  5e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.150597 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0606  NAD synthetase  35.9 
 
 
560 aa  343  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.298865  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1084  NAD synthetase  39.49 
 
 
566 aa  342  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.589136  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3120  NAD+ synthetase  39.02 
 
 
550 aa  342  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1242  NAD synthetase  39.49 
 
 
566 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.628043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1886  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  38.16 
 
 
535 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1990  NAD+ synthetase  39.13 
 
 
561 aa  341  2e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2562  NAD synthetase  38.77 
 
 
545 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.185094  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1089  NAD synthetase  39.49 
 
 
566 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1737  NAD+ synthetase  39.24 
 
 
552 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.364272 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2003  NAD synthetase  37.46 
 
 
559 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  39.86 
 
 
539 aa  340  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1759  NAD synthetase  39.82 
 
 
542 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2040  NAD synthetase  38.05 
 
 
559 aa  339  7e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.105391  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3012  NAD synthetase  39.32 
 
 
566 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0804097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  36.77 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1585  NAD synthetase  39.32 
 
 
609 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.274333  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2322  NAD synthetase  38.72 
 
 
576 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509077  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  39.93 
 
 
554 aa  338  9.999999999999999e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>