52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3099 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3099  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  189  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2868  hypothetical protein  77.17 
 
 
96 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0110329  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1702  phage protein  68 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.18489 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3498  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31940  hypothetical protein  63.83 
 
 
101 aa  68.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2739  hypothetical protein  65.38 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1693  phage protein  78.38 
 
 
101 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0612931 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3227  hypothetical protein  45.95 
 
 
91 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.364796  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6976  hypothetical protein  43.75 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2658  hypothetical protein  57.14 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.65793  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2284  hypothetical protein  57.14 
 
 
100 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585167  hitchhiker  0.000116909 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3899  hypothetical protein  54.9 
 
 
90 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2475  hypothetical protein  54.39 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.683905 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1355  hypothetical protein  56.25 
 
 
90 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0458633  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1943  hypothetical protein  50.94 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0543  hypothetical protein  50.94 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2639  hypothetical protein  47.62 
 
 
109 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1041  hypothetical protein  49.06 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1489  hypothetical protein  50 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3338  hypothetical protein  45.83 
 
 
93 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.282234  normal  0.0307348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1185  hypothetical protein  38.1 
 
 
116 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0786338  normal  0.294594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1019  hypothetical protein  60.53 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1532  hypothetical protein  57.14 
 
 
101 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2071  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000174613  hitchhiker  0.000046797 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2294  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.300358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2181  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1330  hypothetical protein  39.53 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1054  hypothetical protein  39.53 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0257697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0615  hypothetical protein  39.24 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1151  hypothetical protein  38.27 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.324569 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1886  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.325304 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0337  hypothetical protein  37.66 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2745  hypothetical protein  46.94 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0416  hypothetical protein  40.26 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0974  hypothetical protein  36.71 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.102965  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2520  hypothetical protein  34.85 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2764  hypothetical protein  32.93 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0115  hypothetical protein  53.49 
 
 
82 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3981  hypothetical protein  53.49 
 
 
82 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0312325  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3611  conserved hypothetical protein-like protein  35.21 
 
 
105 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1845  hypothetical protein  43.48 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2262  hypothetical protein  52.38 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.490348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0265  hypothetical protein  45.24 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2436  hypothetical protein  50 
 
 
79 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0399057 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5032  putative cytoplasmic protein  47.62 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.423569  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1536  hypothetical protein  45.24 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0480188 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3175  hypothetical protein  36.11 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00239634  normal  0.0518167 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3519  hypothetical protein  47.62 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0169675  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2094  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.360073  normal  0.108616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1758  hypothetical protein  42.86 
 
 
109 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5509  hypothetical protein  41.54 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2652  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.294685  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>