43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2221 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2221  MerR family regulatory protein  100 
 
 		 106 aa  206  9e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.215829  hitchhiker  0.00882524 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1521  hypothetical protein  48.45 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2064  MerR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 106 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1125  hypothetical protein  41.41 
 
 		 100 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.335532 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1383  MerR family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0722  hypothetical protein  44.44 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6287  hypothetical protein  42.71 
 
 		 105 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.518749  normal  0.816406 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0491  hypothetical protein  53.47 
 
 		 118 aa  82  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6321  hypothetical protein  40.95 
 
 		 101 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1224  hypothetical protein  36.84 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.654135  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1272  chaperone-modulator protein CbpM  36.84 
 
 		 106 aa  79  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2131  MerR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.75658  normal  0.434651 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1038  regulatory proteins, MerR family protein  47.37 
 
 		 102 aa  67  0.00000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02200  hypothetical protein  38.96 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2190  hypothetical protein  32.26 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2218  hypothetical protein  31.18 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3022  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2344  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0578  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3237  hypothetical protein  35.42 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4639  hypothetical protein  35.9 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0672421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4904  hypothetical protein  37.18 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4725  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3331  hypothetical protein  30.77 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426882  normal  0.549116 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4847  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218293 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1427  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1816  hypothetical protein  30.85 
 
 		 105 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0617  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0638  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 113 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2701  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0565675  hitchhiker  0.00000000716419 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0050  hypothetical protein  35.8 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2099  hypothetical protein  28.21 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2983  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1430  MerR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0186  hypothetical protein  32.35 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.492764  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2405  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.663215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3861  chaperone-modulator protein CbpM  27.27 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.346166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0048  hypothetical protein  37.66 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.467977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1206  chaperone-modulator protein CbpM  29.27 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.895073  normal  0.418844 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1221  chaperone-modulator protein CbpM  29.27 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.874491 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1175  chaperone-modulator protein CbpM  29.27 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.585707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1070  chaperone-modulator protein CbpM  29.27 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1186  chaperone-modulator protein CbpM  29.27 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>