217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1923 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  100 
 
 
343 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.29623  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2949  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  78.04 
 
 
338 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3155  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  59.32 
 
 
355 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2641  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  61.28 
 
 
346 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.324237  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2305  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  55.26 
 
 
338 aa  322  7e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0958647  normal  0.15261 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1554  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.97 
 
 
338 aa  321  9.000000000000001e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.385209  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.91 
 
 
430 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3570  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.9 
 
 
338 aa  255  8e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0624369  hitchhiker  0.00823889 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2564  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  53.33 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0664726  decreased coverage  0.00223981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2485  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.75 
 
 
358 aa  238  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.151241  normal  0.716859 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2555  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.41 
 
 
348 aa  225  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00193449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2401  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.98 
 
 
349 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.297195  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.97 
 
 
366 aa  216  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000558732  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1394  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.7 
 
 
375 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000899686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0535  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.62 
 
 
372 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000711701  hitchhiker  0.0000117935 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1508  lipid-A-disaccharide synthase  45.05 
 
 
329 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.298775 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0656  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.01 
 
 
331 aa  207  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.137335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2207  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.02 
 
 
331 aa  206  4e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1063  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.94 
 
 
372 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0633  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.99 
 
 
336 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1770  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.08 
 
 
333 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2409  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.19 
 
 
328 aa  200  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1338  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.51 
 
 
349 aa  200  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.82976 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00919  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.19 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.226306  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2728  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.19 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00926  hypothetical protein  43.19 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.241519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2089  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.42 
 
 
335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000632162  normal  0.521337 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1022  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.19 
 
 
328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0136979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2681  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.19 
 
 
328 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.429333 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3208  lipid-A-disaccharide synthase  45.29 
 
 
333 aa  199  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000403525  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1713  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.83 
 
 
326 aa  199  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2530  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  46.6 
 
 
349 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.898614  normal  0.105558 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1013  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00336563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1076  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122696  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1315  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.56 
 
 
385 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2205  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.86 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0766314  normal  0.274166 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2807  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.31 
 
 
349 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0758869  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1468  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.34 
 
 
336 aa  196  6e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1669  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.28 
 
 
339 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1558  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.89 
 
 
337 aa  193  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.88408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1706  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.98 
 
 
339 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.944594  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2421  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.58 
 
 
335 aa  193  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2491  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.58 
 
 
335 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.405986  normal  0.205359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1684  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.98 
 
 
339 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2673  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.45 
 
 
335 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.112968  normal  0.034202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2801  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.39 
 
 
335 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2042  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.81 
 
 
333 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3814  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.24 
 
 
333 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0872881  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2664  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.74 
 
 
328 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1960  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.74 
 
 
328 aa  191  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2180  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.76 
 
 
332 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2576  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.74 
 
 
328 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1639  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.25 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2583  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.77 
 
 
335 aa  189  8e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0354  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.19 
 
 
339 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82798  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1771  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.46 
 
 
330 aa  185  8e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0390  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.87 
 
 
339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1018  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.799043 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0991  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1083  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.252002  normal  0.125044 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1050  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.09 
 
 
325 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.212598 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00587  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  45.92 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.58 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.436451  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2308  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.82 
 
 
337 aa  182  6e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.949257  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01857  tetraacyldisaccharide 4-kinase  37.54 
 
 
349 aa  182  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1434  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.51 
 
 
331 aa  182  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463776  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1099  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.76 
 
 
325 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0312  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.38 
 
 
366 aa  180  4e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1614  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.67 
 
 
333 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.188244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1900  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.44 
 
 
334 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000723906 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1399  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.12 
 
 
339 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2676  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.56 
 
 
338 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270569  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1727  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.89 
 
 
340 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.159463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25510  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.82 
 
 
332 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.30645  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0538  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.95 
 
 
338 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3215  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  44.88 
 
 
335 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.24 
 
 
323 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1511  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.35 
 
 
336 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2387  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.06 
 
 
335 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.624248  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0923  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.33 
 
 
325 aa  174  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.657361  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1092  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.33 
 
 
325 aa  175  9.999999999999999e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.395722  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1476  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.14 
 
 
333 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.114547  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1740  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.12 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1245  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.72 
 
 
327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0284  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  35.79 
 
 
363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003986  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  41.61 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2825  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  42.49 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0571094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2198  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  37.46 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1781  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  40.93 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.168745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1933  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.65 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.313008  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2545  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.65 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0393556  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0734  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.41 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2569  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.65 
 
 
342 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.367774  normal  0.336927 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1373  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.51 
 
 
331 aa  172  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1820  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  38.41 
 
 
341 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118843  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1782  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  36.89 
 
 
323 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2463  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.03 
 
 
342 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2593  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.03 
 
 
342 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0912104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01536  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  39.93 
 
 
335 aa  170  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0751  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  43.03 
 
 
342 aa  169  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.43067  normal  0.485702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>