More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0814 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0814  protein phosphatase 2C domain-containing protein  100 
 
 
299 aa  618  1e-176  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.556106  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1338  protein serine/threonine phosphatases  76.33 
 
 
300 aa  480  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0859  protein serine/threonine phosphatase  66.22 
 
 
300 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0924  protein phosphatase 2C domain-containing protein  66.22 
 
 
300 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1628  protein serine/threonine phosphatases  64.8 
 
 
305 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0588752  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3580  protein serine/threonine phosphatase  65.68 
 
 
304 aa  391  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0568966  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4157  protein phosphatase 2C domain-containing protein  63.09 
 
 
299 aa  393  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4326  protein serine/threonine phosphatase  64.8 
 
 
304 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2031  protein serine/threonine phosphatase  63.21 
 
 
301 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2706  hypothetical protein  58.03 
 
 
306 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0706  protein serine/threonine phosphatase  58.22 
 
 
304 aa  363  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.546937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2476  protein phosphatase 2C-like  48.05 
 
 
304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209161  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1959  protein serine/threonine phosphatase  46.23 
 
 
304 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0968187  normal  0.460535 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0853  protein serine/threonine phosphatases  47.71 
 
 
304 aa  268  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0260925  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2279  protein serine/threonine phosphatase  45.9 
 
 
304 aa  267  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.441681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2158  hypothetical protein  45.9 
 
 
304 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.545474  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4023  protein serine/threonine phosphatase  42.07 
 
 
307 aa  237  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3850  protein phosphatase 2C-like  40.91 
 
 
306 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.632608  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0476  protein serine/threonine phosphatase  40.46 
 
 
302 aa  225  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0044  protein serine/threonine phosphatases  41.32 
 
 
306 aa  225  7e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3007  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
257 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  35.12 
 
 
257 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  38.71 
 
 
236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.91 
 
 
237 aa  109  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2087  Phosphoprotein phosphatase  36.24 
 
 
445 aa  109  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.799207  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  35.43 
 
 
238 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3311  protein phosphatase 2C-like  33.2 
 
 
265 aa  108  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0175137 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  35.37 
 
 
236 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.21 
 
 
320 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0207  protein serine/threonine phosphatase  34.35 
 
 
269 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0073  protein serine/threonine phosphatase  34.29 
 
 
276 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.736868 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  37.61 
 
 
425 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1640  protein serine/threonine phosphatase  31.49 
 
 
259 aa  104  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.8 
 
 
470 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2455  protein serine/threonine phosphatase  27.51 
 
 
263 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  30.71 
 
 
241 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  34.66 
 
 
597 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  34.87 
 
 
276 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 
256 aa  102  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0221  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
252 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0158982  normal  0.296252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6773  protein serine/threonine phosphatase  31.93 
 
 
254 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  35.53 
 
 
319 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.46 
 
 
258 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26780  Protein phosphatase 2C-like protein  31.87 
 
 
256 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0744222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  32.28 
 
 
449 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  34.51 
 
 
305 aa  99.4  7e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.37 
 
 
611 aa  99  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  35.63 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2515  protein phosphatase 2C-like protein  31.73 
 
 
250 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00146848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1956  protein serine/threonine phosphatase  32.63 
 
 
252 aa  97.8  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2317  protein serine/threonine phosphatases  33.18 
 
 
253 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  37.05 
 
 
571 aa  97.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3243  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.193605  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  31.91 
 
 
241 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1281  protein phosphatase 2C, family protein  33.61 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0174873 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  36.74 
 
 
452 aa  97.1  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2176  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 
255 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4487  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.64 
 
 
276 aa  96.3  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  31.35 
 
 
435 aa  95.9  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  32.74 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3905  protein phosphatase 2C, family protein  32.77 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3911  protein phosphatase 2C, family protein  32.77 
 
 
250 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00759047  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.89 
 
 
247 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  35.78 
 
 
348 aa  95.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  33.64 
 
 
564 aa  95.1  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.11 
 
 
238 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3714  protein phosphatase 2C, family protein  32.35 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3604  protein phosphatase 2C  32.35 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3962  protein phosphatase 2C, family protein  32.77 
 
 
250 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4001  protein phosphatase 2C, family protein  32.35 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3877  protein phosphatase 2C, family protein  32.35 
 
 
250 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.65196e-21 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  35.04 
 
 
477 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.51 
 
 
389 aa  94.7  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  33.2 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3187  protein serine/threonine phosphatase  31.12 
 
 
415 aa  94  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000686686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  30.08 
 
 
241 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  31.47 
 
 
538 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 
256 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  34.87 
 
 
256 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000018  serine/threonine protein phosphatase  33.08 
 
 
264 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  34.06 
 
 
234 aa  93.6  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  31.8 
 
 
250 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  34.85 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1901  protein serine/threonine phosphatase  34.39 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1827  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.39 
 
 
267 aa  92.8  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.179821  normal  0.768093 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2007  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3498  protein serine/threonine phosphatase  32.23 
 
 
256 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243056  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  34.72 
 
 
469 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  32.31 
 
 
256 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3622  protein serine/threonine phosphatase  32.11 
 
 
271 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00717219  decreased coverage  0.000139718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  33.9 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  33.91 
 
 
394 aa  92  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  30.64 
 
 
245 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  34.12 
 
 
395 aa  91.7  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  32.87 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3315  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.36 
 
 
259 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  31.94 
 
 
554 aa  90.9  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1066  protein serine/threonine phosphatase  30.33 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3686  protein serine/threonine phosphatase  32.37 
 
 
250 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>