49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0127 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0127  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  100 
 
 		 347 aa  715    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3159  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  66.24 
 
 		 340 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2303  polyhydroxybutyrate depolymerase  54.19 
 
 		 348 aa  333  3e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2280  hypothetical protein  54.05 
 
 		 341 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2146  polyhydroxybutyrate depolymerase  54.05 
 
 		 341 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286329  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2089  polyhydroxybutyrate depolymerase  54.05 
 
 		 341 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2068  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  45 
 
 		 358 aa  284  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.151389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2417  Fibronectin type III domain protein  46.96 
 
 		 485 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1238  fibronectin, type III domain-containing protein  45.4 
 
 		 485 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.109718  normal  0.858985 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34710  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase protein  43.39 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.222008  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4785  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.98 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4259  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  44.98 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1977  polyhydroxybutyrate depolymerase  38.64 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0176  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  40.06 
 
 		 375 aa  245  9e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02265  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.41 
 
 		 353 aa  241  1e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5512  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  38.24 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292347 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.27 
 
 		 506 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4772  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.43 
 
 		 356 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.826591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1082  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.57 
 
 		 352 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5328  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  37.07 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1585  putative depolymerase  38.07 
 
 		 362 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0731101  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0665  poly (3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.21 
 
 		 355 aa  208  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.097547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2373  fibronectin, type III domain-containing protein  37.16 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07987  polyhydroxybutyrate depolymerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03560)  36.24 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.445833  normal  0.346264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5556  putative depolymerase  30.75 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1647  putative depolymerase  31.27 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543513  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4864  putative depolymerase  31.82 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  34 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  31.96 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  34 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  34 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3344  PHB depolymerase family esterase  33.66 
 
 		 429 aa  47.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.335799  normal  0.68562 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  39.62 
 
 		 396 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  32 
 
 		 364 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  25.76 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  36.23 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  31.33 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5954  PHB depolymerase family esterase  28.3 
 
 		 438 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159743 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3230  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.891696  normal  0.152859 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  32.88 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3759  PHB depolymerase family esterase  33.33 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6240  PHB depolymerase family esterase  28.46 
 
 		 466 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.721378 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6025  PHB depolymerase family esterase  31.85 
 
 		 416 aa  43.5  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950963  normal  0.103792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  27.27 
 
 		 372 aa  43.1  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  30.12 
 
 		 398 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>