More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0805 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0805  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  201  4e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1336  50S ribosomal protein L21  57.28 
 
 		 104 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100172  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1350  50S ribosomal protein L21  56.31 
 
 		 104 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  94.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 105 aa  94.4  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  46.08 
 
 		 103 aa  93.2  9e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1008  50S ribosomal protein L21P  48.08 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000012148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  46.15 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.5  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 102 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  45.71 
 
 		 104 aa  89.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  47.06 
 
 		 149 aa  88.6  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  41.9 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  87.8  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  40.38 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  87.8  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  87.4  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1452  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000564167  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  84.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 102 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0496  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 115 aa  84.3  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  3.70473e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  84  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0688  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1683  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000196723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 104 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0749  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 101 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000486349  hitchhiker  0.00474582 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 104 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 103 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  82.8  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>