49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3326 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  75.28 
 
 		 452 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  77.75 
 
 		 441 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  71.75 
 
 		 445 aa  634    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  73.21 
 
 		 475 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 445 aa  900    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  73.88 
 
 		 446 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  74.29 
 
 		 458 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  72.13 
 
 		 444 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  72.58 
 
 		 443 aa  625  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  72.16 
 
 		 448 aa  623  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  72.42 
 
 		 445 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  65.25 
 
 		 420 aa  538  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  66.24 
 
 		 417 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  65.55 
 
 		 435 aa  535  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  65.22 
 
 		 423 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  62.84 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  57.63 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  57.63 
 
 		 422 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  53.35 
 
 		 425 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  53.13 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  53.48 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  54.9 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  54.55 
 
 		 426 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  51.03 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  51.02 
 
 		 424 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  50.9 
 
 		 424 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  52.52 
 
 		 420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  52.19 
 
 		 422 aa  352  1e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  43.42 
 
 		 486 aa  346  5e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  47.15 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  42.22 
 
 		 482 aa  339  7e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  42.18 
 
 		 480 aa  333  4e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  41.54 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  44.7 
 
 		 428 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  44.36 
 
 		 407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  43.19 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  41.33 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  38.38 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  35.57 
 
 		 410 aa  232  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  26.13 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0345  imelysin  25.72 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.10473 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2721  Peptidase M75, Imelysin  25.5 
 
 		 425 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00128061  normal  0.730271 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0791  putative lipoprotein  24.94 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0671  putative lipoprotein  25.22 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  23.04 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  25.64 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  24.04 
 
 		 356 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0811  putative lipoprotein  23.17 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0333  hypothetical protein  33.61 
 
 		 374 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>