More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1970 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3304  putative peptidase  56.17 
 
 
608 aa  635    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1970  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  100 
 
 
652 aa  1319    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0646557  normal  0.172612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38770  putative peptidase  55.71 
 
 
608 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41620  peptidase  53.16 
 
 
651 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0404  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.23 
 
 
607 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903188  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4828  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  51 
 
 
607 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4675  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  48.84 
 
 
608 aa  560  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0375  prolyl oligopeptidase family protein  50.46 
 
 
612 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5162  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  49.36 
 
 
574 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0400  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  50.46 
 
 
607 aa  547  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0508  hypothetical protein  47.3 
 
 
610 aa  532  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2053  peptidase  35.24 
 
 
643 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.58101  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3959  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.61 
 
 
646 aa  327  5e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1371  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.58 
 
 
644 aa  326  7e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0459  prolyl oligopeptidase family protein  33.18 
 
 
636 aa  326  1e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1709  peptidase catalytic subunit  32.83 
 
 
636 aa  324  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1344  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.71 
 
 
629 aa  323  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000317617 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1156  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.84 
 
 
643 aa  317  6e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1335  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.2 
 
 
643 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0748  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.82 
 
 
644 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.049006  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1236  hypothetical protein  32 
 
 
665 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0719  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.66 
 
 
644 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3030  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.69 
 
 
644 aa  306  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1383  prolyl oligopeptidase family protein  32.22 
 
 
686 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1945  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.43 
 
 
662 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.956519  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2053  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.66 
 
 
644 aa  300  8e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.197732 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4185  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.83 
 
 
655 aa  298  2e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1579  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.13 
 
 
642 aa  296  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.405414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.39 
 
 
693 aa  286  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0608  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  34.78 
 
 
645 aa  283  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1489  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.5 
 
 
646 aa  277  3e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.475976  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2763  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.6 
 
 
677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376368  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0806  putative acyl-peptide hydrolase  33.87 
 
 
661 aa  274  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0875582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1483  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
683 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.240771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1675  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.18 
 
 
683 aa  273  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.270345  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1503  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
682 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1533  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
682 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2848  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.38 
 
 
682 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000237688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1497  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
682 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2589  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.7 
 
 
677 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00363766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1686  prolyl oligopeptidase family protein  28.7 
 
 
678 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1406  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.89 
 
 
676 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.999048  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2656  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.55 
 
 
677 aa  267  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03061  esterase/lipase/thioesterase family protein  29.95 
 
 
652 aa  256  7e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3161  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.9 
 
 
662 aa  251  4e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464305  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2219  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.94 
 
 
626 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.194335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3832  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.92 
 
 
643 aa  250  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3193  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.45 
 
 
675 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.453566  normal  0.217574 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2275  putative peptidase  33.22 
 
 
635 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.573468  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3290  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  33.01 
 
 
668 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00273825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2774  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.01 
 
 
677 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0668  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.79 
 
 
719 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.37275  normal  0.141297 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0587  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.61 
 
 
623 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00771  esterase/lipase/thioesterase family protein  28.31 
 
 
645 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.248963  normal  0.78651 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0408  putative peptidase  32.07 
 
 
639 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19830  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  30.61 
 
 
641 aa  226  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646279  hitchhiker  0.000217512 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30410  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl peptidase  29.57 
 
 
702 aa  219  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1432  dienelactone hydrolase  25.4 
 
 
644 aa  213  7e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.839365  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01331  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.08 
 
 
644 aa  211  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.180596  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00801  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.1 
 
 
641 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6757  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.79 
 
 
663 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956088  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0071  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.52 
 
 
641 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00811  esterase/lipase/thioesterase family protein  23.36 
 
 
641 aa  184  6e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00781  esterase/lipase/thioesterase family protein  24.02 
 
 
642 aa  181  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1960  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  26.57 
 
 
610 aa  153  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.317631  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3453  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.17 
 
 
640 aa  153  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000252279  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06914  prolyl oligopeptidase  30.24 
 
 
655 aa  134  5e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000910  putative peptidase  30.77 
 
 
640 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.982884  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0706  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  32.4 
 
 
656 aa  130  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.155251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6187  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.76 
 
 
656 aa  128  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.317055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.46 
 
 
597 aa  127  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000276973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1350  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.45 
 
 
655 aa  126  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3511  prolyl oligopeptidase family protein  27.39 
 
 
638 aa  125  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4772  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.07 
 
 
632 aa  124  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6730  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  34.48 
 
 
632 aa  124  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.907657  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1266  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  31.91 
 
 
631 aa  124  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.211135  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1669  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.77 
 
 
629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0398  peptidase  33.18 
 
 
657 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2643  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.9 
 
 
644 aa  122  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2303  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  33.91 
 
 
615 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1353  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  30.74 
 
 
629 aa  121  3.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.262385  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0897  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.2 
 
 
600 aa  121  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.835581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5922  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.54 
 
 
626 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  35.68 
 
 
606 aa  119  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0522  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.65 
 
 
610 aa  119  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.450113  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0581  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.83 
 
 
628 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.402001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4518  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.62 
 
 
652 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.164406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0448  peptidase  31.51 
 
 
678 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.547634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4393  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.63 
 
 
626 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0476  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.82 
 
 
688 aa  115  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8147  hypothetical protein  31.45 
 
 
634 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0602  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  33.33 
 
 
653 aa  114  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0774537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.73 
 
 
594 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4261  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  27.12 
 
 
652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03802  dipeptidyl anminopeptidase  31.92 
 
 
694 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2493  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.72 
 
 
607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.530992  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2052  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  27.86 
 
 
630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.55137  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1930  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  27.67 
 
 
646 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0323  prolyl oligopeptidase family protein  29.79 
 
 
649 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0766  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.07 
 
 
641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>