42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1885 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1885  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.769713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  73.02 
 
 		 63 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  74.19 
 
 		 64 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  74.19 
 
 		 63 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  74.19 
 
 		 63 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  74.19 
 
 		 63 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  74.19 
 
 		 63 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2054  hypothetical protein  79.37 
 
 		 63 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.280608  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1863  hypothetical protein  79.37 
 
 		 63 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0931519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  63.64 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1731  hypothetical protein  80.95 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  50.85 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  50.85 
 
 		 67 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  49.15 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  45 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1550  hypothetical protein  64.29 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  50.94 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  39.29 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  43.33 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3291  hypothetical protein  44.07 
 
 		 62 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  54 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  46.3 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  52.17 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  46.3 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  60.47 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  45.24 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0042  hypothetical protein  47.62 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  43.4 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  38.46 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  38.46 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  44.23 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2919  hypothetical protein  45.76 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000365079  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1454  hypothetical protein  48.28 
 
 		 73 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4181  hypothetical protein  50.94 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.699697 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1316  hypothetical protein  53.33 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.153432  normal  0.0791201 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0402  hypothetical protein  44 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00151461  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3296  hypothetical protein  33.93 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000212435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2229  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0305  hypothetical protein  32.79 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000556725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>