32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1456 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1456  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  276  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4767  hypothetical protein  51.02 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54550  hypothetical protein  51.7 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000543729  normal  0.0724401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3967  membrane protein TctB, putative  45.83 
 
 		 152 aa  120  5e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.605379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4233  membrane protein TctB, putative  46.53 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1826  membrane protein TctB, putative  44.52 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  45.14 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4304  hypothetical protein  47.22 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836999  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1417  tricarboxylate transport protein TctB, putative  47.55 
 
 		 161 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.342625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4394  tricarboxylate transport protein TctB  47.92 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49470  tripartite tricarboxylate transporter small hypothetical protein  46.85 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0240129  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1057  tricarboxylate transport protein TctB  47.22 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3343  tricarboxylic transport  43.26 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.363295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2931  tricarboxylic transport  41.38 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.331411  normal  0.167192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3086  tricarboxylic transport  41.38 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2899  tricarboxylic transport  41.38 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2966  tricarboxylic transport  41.38 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00298616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2983  tricarboxylic transport  41.38 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.545092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1362  tricarboxylic transport  42.14 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2582  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.909963  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0733  hypothetical protein  36.69 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.59707  decreased coverage  0.00107456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4434  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.5 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0155  TctB protein  37.86 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0903  putative tricarboxylic transport membrane protein  28.37 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.530268  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3855  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.5 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.760581  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0725  putative tricarboxylic transport membrane protein  37.96 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1637  TctB protein  27.86 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.21 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1800  hypothetical protein  27.56 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.490656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2440  hypothetical protein  39.6 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0482298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2896  putative tricarboxylic transport membrane protein  37.5 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1959  hypothetical protein  30.58 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.202107  normal  0.64618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>