More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1116 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 297 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  78.91 
 
 		 297 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  75.42 
 
 		 299 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  77.21 
 
 		 296 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  77.21 
 
 		 296 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  77.89 
 
 		 296 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  79.46 
 
 		 298 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  77.21 
 
 		 296 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  78.79 
 
 		 300 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  74.07 
 
 		 299 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  67.37 
 
 		 302 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  57.44 
 
 		 290 aa  353  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.83 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.97 
 
 		 306 aa  239  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.65 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.61 
 
 		 297 aa  236  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.62 
 
 		 303 aa  236  4e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.63 
 
 		 301 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.07 
 
 		 296 aa  234  9e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.55 
 
 		 297 aa  234  9e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.1 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.44 
 
 		 303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.62 
 
 		 299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.17 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.17 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.17 
 
 		 305 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  46.01 
 
 		 297 aa  232  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  231  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  44 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.93 
 
 		 297 aa  229  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.93 
 
 		 297 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.46 
 
 		 306 aa  229  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.29 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.83 
 
 		 298 aa  229  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.16 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.36 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.36 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.36 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.94 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.36 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.36 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.56 
 
 		 297 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  49.14 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  46.62 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.06 
 
 		 311 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.43 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.32 
 
 		 299 aa  223  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.71 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.8 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.21 
 
 		 297 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.36 
 
 		 311 aa  221  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.48 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  47.64 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  48.15 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4135  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.34 
 
 		 298 aa  215  9e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.931472  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.06 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.58 
 
 		 318 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1891  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.05 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03558  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.36 
 
 		 313 aa  211  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.59 
 
 		 298 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  43.01 
 
 		 302 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  40.66 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2123  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.01 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.876879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1904  chromosome replication initiation inhibitor protein  45.56 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.188746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  44.56 
 
 		 301 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.37 
 
 		 305 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  44.61 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.11 
 
 		 297 aa  202  6e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.51 
 
 		 297 aa  201  9e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.75 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.4 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.35 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1012  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.37 
 
 		 298 aa  199  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.06 
 
 		 316 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.4 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  41.75 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0880  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.19 
 
 		 284 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00176  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.4 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1175  chromosome replication initiation inhibitor protein  42.96 
 
 		 297 aa  193  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.578075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0072  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.8 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.608118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0091  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.8 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3530  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.127764 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02747  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0777  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0794  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02710  hypothetical protein  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3243  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.361223  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  40.77 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>