More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00176 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00176  chromosome replication initiation inhibitor protein  100 
 
 		 294 aa  611  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3530  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 292 aa  299  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0717284  normal  0.127764 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4057  chromosome replication initiation inhibitor protein  39.34 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1116  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.71 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472937 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2433  chromosome replication initiation inhibitor protein  37.97 
 
 		 302 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4934  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.6 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4483  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.24 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56740  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.6 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2974  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.88 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2388  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.12 
 
 		 297 aa  188  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00311135  hitchhiker  0.00401295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2144  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.12 
 
 		 297 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.184842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4361  chromosome initiation inhibitor  38.6 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0658  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.64 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.117033  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0917  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.52 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4471  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.18 
 
 		 296 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0956  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.18 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480683  normal  0.474013 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0983  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.03 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1399  chromosome replication initiation inhibitor protein  38.13 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4249  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.45 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.373423  normal  0.150215 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3162  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.58 
 
 		 303 aa  178  8e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4164  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.45 
 
 		 299 aa  178  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.221393  normal  0.317315 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2509  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.69 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1844  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.76 
 
 		 295 aa  175  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.225634  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2836  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284111  normal  0.240548 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4135  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.931472  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.65 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3862  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.02 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2987  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.58 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2434  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.21 
 
 		 295 aa  170  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.609977  hitchhiker  0.000411507 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3863  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.68 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.807931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2774  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.01 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1829  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.999172  hitchhiker  0.00188164 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002477  chromosome initiation inhibitor  31.97 
 
 		 298 aa  168  8e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1974  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.11 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0576454  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2594  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.44 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000186754  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2671  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000215658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2012  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 298 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0982  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1788  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.11 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405332  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2358  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.89 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.17613  normal  0.155084 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03558  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.29 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1012  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.96 
 
 		 298 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4178  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.35 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.257723  normal  0.264843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2173  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.85 
 
 		 297 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.342879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  32 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1704  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.33 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.305056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0050  chromosome replication initiation inhibitor protein  32 
 
 		 297 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0711  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.95 
 
 		 308 aa  165  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3099  transcriptional regulator LysR family  34.25 
 
 		 301 aa  165  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2556  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.77 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000319404  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1507  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.31 
 
 		 297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3474  chromosome replication initiation inhibitor protein  35.14 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0034  chromosome replication initiation inhibitor protein  32 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3749  transcriptional regulator, ArgP, LysR family  33.22 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2962  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.97 
 
 		 297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2085  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.76 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4371  chromosome replication initiation inhibitor protein  36.2 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1698  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.11 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2866  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.67 
 
 		 306 aa  161  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1573  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.23 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.187685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3925  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.15 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.567079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1337  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.85 
 
 		 290 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.449997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1473  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.45 
 
 		 297 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0854  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.15 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00300239  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0857  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.15 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3821  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.15 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.353961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3409  transcriptional regulator ArgP, LysR family  33.1 
 
 		 299 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.305012  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2344  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.33 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0367629  hitchhiker  0.0000000918792 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0030  chromosome replication initiation inhibitor protein  31 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3693  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.01 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0036  chromosome replication initiation inhibitor protein  31 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1463  chromosome replication initiation inhibitor protein  31 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1183  chromosome replication initiation inhibitor protein  31 
 
 		 297 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2416  chromosome replication initiation inhibitor protein  33 
 
 		 305 aa  158  9e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.343193  hitchhiker  0.00112785 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1538  chromosome replication initiation inhibitor protein  31 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0518  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1652  chromosome replication initiation inhibitor protein  33 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.963239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3139  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.63 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.677329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3225  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0441076  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3237  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3404  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.269089  normal  0.216257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3302  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.779303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3299  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.22 
 
 		 297 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.335083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3334  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.51 
 
 		 297 aa  157  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.197754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0559  chromosome replication initiation inhibitor protein  33.45 
 
 		 297 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5298  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.63 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5007  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.29 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1009  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.75 
 
 		 295 aa  155  8e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5123  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.63 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3148  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.29 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.99123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4487  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.63 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5736  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.63 
 
 		 297 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3684  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.51 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3878  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.86 
 
 		 297 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0132  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.98 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1085  chromosome replication initiation inhibitor protein  31.63 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0282228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3123  chromosome replication initiation inhibitor protein  34.44 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.714101  hitchhiker  0.0033883 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3074  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.51 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.093516  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3336  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.51 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3052  chromosome replication initiation inhibitor protein  32.51 
 
 		 297 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>