More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0449 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0691  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  76.69 
 
 		 468 aa  738    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000631949  unclonable  0.000000000159146 
 
 
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NC_004578  PSPTO_5068  adenosylhomocysteinase  89.98 
 
 		 469 aa  869    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.724438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0460  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.98 
 
 		 469 aa  874    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0968  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  72.88 
 
 		 474 aa  706    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0571313 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0534  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.66 
 
 		 465 aa  736    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5280  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  90.62 
 
 		 469 aa  884    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4849  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.9 
 
 		 469 aa  895    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0532  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.55 
 
 		 465 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0449  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  100 
 
 		 469 aa  971    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_03570  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  89.89 
 
 		 465 aa  858    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0760213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0469  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.47 
 
 		 467 aa  740    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.410988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1448  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.31 
 
 		 474 aa  707    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5025  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.04 
 
 		 469 aa  887    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0414  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  77.83 
 
 		 470 aa  724    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05620  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  93.39 
 
 		 469 aa  902    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0489  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  91.04 
 
 		 469 aa  887    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3043  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  75.64 
 
 		 464 aa  733    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.365932  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0915  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  73.28 
 
 		 473 aa  709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2003  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.48 
 
 		 441 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1998  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  57.48 
 
 		 441 aa  520  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008789  Hhal_1675  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.26 
 
 		 430 aa  513  1e-144  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.146428  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_2679  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.35 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.455308  n/a   
 
 
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NC_009484  Acry_1228  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  59.35 
 
 		 435 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.389132  n/a   
 
 
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NC_011365  Gdia_2130  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  58.82 
 
 		 432 aa  504  1e-141  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.421073  normal  0.933423 
 
 
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NC_010117  COXBURSA331_A0052  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.3 
 
 		 434 aa  495  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009727  CBUD_2132  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.09 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_03785  S-adenosylhomocysteine hydrolase  56.71 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186899  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3674  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.26 
 
 		 438 aa  485  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3331  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.64 
 
 		 441 aa  485  1e-136  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.276204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4522  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  56.28 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0895169  normal  1 
 
 
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NC_006686  CND00240  adenosylhomocysteinase, putative  57.05 
 
 		 431 aa  481  1e-134  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.672849  n/a   
 
 
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NC_009441  Fjoh_1579  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.78 
 
 		 438 aa  478  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0204825  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_4338  adenosylhomocysteinase  55.6 
 
 		 436 aa  479  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.588356  normal  0.419207 
 
 
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BN001308  ANIA_01263  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase (Eurofung)  55.03 
 
 		 449 aa  465  9.999999999999999e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0454669  normal  0.150578 
 
 
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NC_007643  Rru_A3444  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.8 
 
 		 467 aa  461  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.893839  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1392  Adenosylhomocysteinase  51.49 
 
 		 475 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.23034 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76463  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  55.46 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0610  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.31 
 
 		 435 aa  463  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4056  adenosylhomocysteinase  50.3 
 
 		 476 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1718  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.83 
 
 		 472 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010577  XfasM23_0314  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52 
 
 		 480 aa  459  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007777  Francci3_4454  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.59 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.787736  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7602  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.35 
 
 		 485 aa  461  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.588423 
 
 
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NC_009921  Franean1_0112  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.37 
 
 		 478 aa  461  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161463  normal  1 
 
 
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NC_009483  Gura_3005  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.82 
 
 		 464 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.309685  n/a   
 
 
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NC_008820  P9303_01751  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.04 
 
 		 476 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008816  A9601_18351  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.74 
 
 		 477 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0813931  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_0763  adenosylhomocysteinase  50.59 
 
 		 475 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.401892  normal  0.121264 
 
 
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NC_013235  Namu_4257  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.58 
 
 		 498 aa  456  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.892606  normal  1 
 
 
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NC_009380  Strop_0966  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.2 
 
 		 496 aa  455  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.161816  normal  0.729382 
 
 
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NC_010622  Bphy_2918  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.98 
 
 		 473 aa  456  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010513  Xfasm12_0349  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52 
 
 		 480 aa  458  1e-127  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_27010  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.200698  normal  0.751146 
 
 
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NC_014158  Tpau_1192  adenosylhomocysteinase  50.1 
 
 		 488 aa  457  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4356  adenosylhomocysteinase  50.1 
 
 		 485 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39009  normal  1 
 
 
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NC_010084  Bmul_0180  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.28 
 
 		 472 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0500426 
 
 
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NC_011901  Tgr7_2895  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.28 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2505  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  49.9 
 
 		 478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_0199  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.68 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.868266  normal  1 
 
 
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NC_009091  P9301_18171  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.44 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4610  adenosylhomocysteinase  50 
 
 		 483 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_0057  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007651  BTH_I3165  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A1701  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0254  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.49 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2835  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.49 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_2039  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  54.47 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.970546  normal  0.403341 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3838  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3134  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2440  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.82 
 
 		 469 aa  453  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0186  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.68 
 
 		 472 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.433145  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_0272  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.49 
 
 		 472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786714  n/a   
 
 
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NC_008609  Ppro_0041  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  53.44 
 
 		 465 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0210952  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1432  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.2 
 
 		 476 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1746  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.2 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0903  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3417  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.58 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1875  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.9 
 
 		 475 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0379318  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0138  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.38 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.599517  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_3842  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.22 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.902922  n/a   
 
 
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NC_007335  PMN2A_1202  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.81 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2519  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.49 
 
 		 514 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.595006 
 
 
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NC_009338  Mflv_4717  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.69 
 
 		 486 aa  451  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3375  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.29 
 
 		 472 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_3755  adenosylhomocysteinase  49.8 
 
 		 478 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281872  normal  1 
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0102  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.86 
 
 		 476 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.640394  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_1294  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.83 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000792408  hitchhiker  0.0000266691 
 
 
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NC_014148  Plim_3615  adenosylhomocysteinase  52.7 
 
 		 450 aa  451  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_4153  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.97 
 
 		 481 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.370152  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_1597  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.71 
 
 		 471 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008578  Acel_0468  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.49 
 
 		 476 aa  449  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.682945 
 
 
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NC_011004  Rpal_4545  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.51 
 
 		 469 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_13277  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.3 
 
 		 495 aa  450  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.85823  normal  0.713037 
 
 
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NC_008817  P9515_18141  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.72 
 
 		 479 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.305772  n/a   
 
 
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NC_008819  NATL1_20771  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  51.81 
 
 		 477 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.215343  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_5919  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  50.79 
 
 		 476 aa  445  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_3656  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.02 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009976  P9211_17511  S-adenosyl-L-homocysteine hydrolase  52.74 
 
 		 476 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.424526  normal  1 
 
 
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