26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0517 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0517  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  418  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.590725 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0736  hypothetical protein  79.52 
 
 
211 aa  322  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0108422 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1445  hypothetical protein  72.38 
 
 
211 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1810  hypothetical protein  77.84 
 
 
211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0781  hypothetical protein  69.52 
 
 
211 aa  270  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0900  hypothetical protein  74.74 
 
 
210 aa  268  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00462519  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0839  hypothetical protein  77.17 
 
 
213 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0016  hypothetical protein  62.38 
 
 
215 aa  249  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0223  hypothetical protein  65.17 
 
 
208 aa  230  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00564186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2295  hypothetical protein  61.86 
 
 
199 aa  227  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.359006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2279  hypothetical protein  51.15 
 
 
234 aa  207  1e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2186  hypothetical protein  53.5 
 
 
237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0049  hypothetical protein  61.54 
 
 
227 aa  198  6e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03610  hypothetical protein  51.08 
 
 
210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.968992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1132  hypothetical protein  46.67 
 
 
192 aa  159  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.865569 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1629  putative cytoplasmic protein  49.73 
 
 
198 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1124  hypothetical protein  34.97 
 
 
198 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.782486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0869  hypothetical protein  28.42 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.321241  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03538  hypothetical protein  30.18 
 
 
232 aa  59.7  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.179274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3163  hypothetical protein  26.56 
 
 
236 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4004  hypothetical protein  29.34 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0137865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49820  hypothetical protein  26.13 
 
 
220 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2512  hypothetical protein  26.67 
 
 
266 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.352212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03265  hypothetical protein  25.99 
 
 
249 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258096  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22900  hypothetical protein  26.53 
 
 
226 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0064  hypothetical protein  25.52 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.333166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>