21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4127 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4127  hypothetical protein  100 
 
 		 1053 aa  2118    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2182  Serine/threonine protein kinase-related protein  24.62 
 
 		 1060 aa  82.8  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2177  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.53 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.795187  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1492  secretion protein HlyD family protein  33.79 
 
 		 284 aa  55.5  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.76 
 
 		 358 aa  52.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3072  RND family efflux transporter MFP subunit  27.35 
 
 		 404 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.569417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3738  HlyD family secretion protein  26.06 
 
 		 265 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  25.89 
 
 		 348 aa  49.7  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  29.45 
 
 		 366 aa  48.9  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4163  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.07 
 
 		 350 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000250075  normal  0.807389 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1680  RND family efflux transporter MFP subunit  29.05 
 
 		 360 aa  47.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.560813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2064  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.71 
 
 		 365 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0419  membrane-fusion protein  29.6 
 
 		 242 aa  47  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.900766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3700  secretion protein HlyD  30.26 
 
 		 381 aa  47  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0972  secretion protein HlyD  30.82 
 
 		 353 aa  47  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3679  RND family efflux transporter MFP subunit  25.71 
 
 		 365 aa  46.2  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3140  secretion protein HlyD  30.9 
 
 		 360 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1169  secretion protein HlyD family protein  28.22 
 
 		 288 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.595909  decreased coverage  0.00058772 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0237  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 397 aa  45.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0374  Multidrug resistance efflux pump-like protein  31.5 
 
 		 271 aa  44.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0800097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1152  secretion protein HlyD family protein  33.7 
 
 		 289 aa  44.7  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.633173  normal  0.115972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>