54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3480 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3480  UspA domain protein  100 
 
 		 119 aa  242  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1781  UspA domain-containing protein  41.44 
 
 		 285 aa  94.7  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1481  hypothetical protein  35.14 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.869446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3356  hypothetical protein  35.34 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2439  hypothetical protein  32.46 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2854  hypothetical protein  32.38 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.148058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1548  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.466583  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1336  hypothetical protein  30.17 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0232  hypothetical protein  30.56 
 
 		 114 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.190765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1240  hypothetical protein  30.63 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.370362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0884  hypothetical protein  31.78 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3056  hypothetical protein  31.37 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.3077  normal  0.011343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2658  hypothetical protein  42.47 
 
 		 227 aa  60.5  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0045  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000429273 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2442  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0160  hypothetical protein  28.85 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2063  hypothetical protein  30.56 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0873  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3715  hypothetical protein  31.03 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3250  hypothetical protein  31.03 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2519  hypothetical protein  29.09 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.063986  normal  0.852215 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3682  hypothetical protein  29.31 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3149  hypothetical protein  30.77 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0576  hypothetical protein  28.97 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1733  hypothetical protein  28.83 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000965174 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2220  hypothetical protein  28.7 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00202987  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3102  hypothetical protein  29.47 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2981  hypothetical protein  29.81 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5736  hypothetical protein  27.68 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.853657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2821  hypothetical protein  25.45 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.236518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1492  hypothetical protein  26.92 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2602  hypothetical protein  25.93 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0738008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1029  hypothetical protein  28.85 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.674916 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1041  hypothetical protein  28.85 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1109  hypothetical protein  28.95 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.705839 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3331  hypothetical protein  27.88 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1008  hypothetical protein  27.88 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0256  hypothetical protein  26.61 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0839  hypothetical protein  28.21 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360004 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1638  hypothetical protein  26.85 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0416797 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2331  hypothetical protein  22.73 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2511  hypothetical protein  25 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1563  hypothetical protein  26.85 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1767  hypothetical protein  24.07 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1811  hypothetical protein  24.07 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1774  hypothetical protein  24.07 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1957  hypothetical protein  23.53 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0991042  normal  0.534316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1630  hypothetical protein  26.85 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.634363  normal  0.124961 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2890  hypothetical protein  24.55 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1540  hypothetical protein  24.37 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0403582  normal  0.2792 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1323  hypothetical protein  26.32 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804067  normal  0.155599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1011  hypothetical protein  25.64 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.116392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0759  hypothetical protein  25.64 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6777  hypothetical protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>