26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0620 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  437  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5931  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  42.94 
 
 		 507 aa  115  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3699  hypothetical protein  36.81 
 
 		 503 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  38.6 
 
 		 474 aa  75.1  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6624  hypothetical protein  40.37 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  0.194539 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3648  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.54 
 
 		 1655 aa  70.5  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152194  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1542  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  36.3 
 
 		 344 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.400143  hitchhiker  0.0000648259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2712  hypothetical protein  30.05 
 
 		 468 aa  65.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0961  hypothetical protein  28.33 
 
 		 729 aa  65.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000466384  normal  0.0803995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1976  Planctomycete cytochrome C  28.89 
 
 		 724 aa  64.7  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0817  hypothetical protein  31.33 
 
 		 465 aa  59.3  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_1199  predicted protein  39.18 
 
 		 486 aa  58.9  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0489  hypothetical protein  35.16 
 
 		 452 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2175  hypothetical protein  43.96 
 
 		 437 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2988  hypothetical protein  34.83 
 
 		 456 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.874903  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2007  heat shock protein DnaJ domain protein  35.71 
 
 		 441 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8484999999999997e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2220  heat shock protein DnaJ domain protein  35.71 
 
 		 441 aa  53.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.300892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  42.99 
 
 		 1085 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0020  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  37.35 
 
 		 481 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000120001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1831  hypothetical protein  25 
 
 		 621 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2893  chitinase II  32.14 
 
 		 587 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000583173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1357  GALA protein 5  29.25 
 
 		 647 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.146674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1593  hypothetical protein  36.52 
 
 		 716 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4051  hypothetical protein  32.81 
 
 		 400 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1579  hypothetical protein  25.48 
 
 		 464 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1356  GALA protein 4  26.22 
 
 		 620 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>