More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0439 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0439  ribosomal protein L11  100 
 
 		 144 aa  286  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0481  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.258775  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0855  50S ribosomal protein L11  59.85 
 
 		 140 aa  174  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2425  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0323848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0466  50S ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 141 aa  174  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00268184  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0538  50S ribosomal protein L11  60.14 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.337487  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1069  50S ribosomal protein L11  60.87 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.992006  normal  0.908798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1929  ribosomal protein L11  58.7 
 
 		 142 aa  167  4e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0010311  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0284  ribosomal protein L11  60.58 
 
 		 142 aa  166  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000710656  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1511  ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000218228  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1520  50S ribosomal protein L11  56.25 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000275325  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1798  50S ribosomal protein L11  57.64 
 
 		 141 aa  164  5e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000782975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4355  ribosomal protein L11  58.09 
 
 		 142 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2335  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00025621  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0521  ribosomal protein L11  54.86 
 
 		 144 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0211  50S ribosomal protein L11  55.8 
 
 		 142 aa  162  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00574728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1632  50S ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.95561  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0690  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.87435e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2180  ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1020  50S ribosomal protein L11  53.62 
 
 		 141 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00641333 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2658  50S ribosomal protein L11P  57.35 
 
 		 142 aa  161  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2472  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 141 aa  161  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000025997  hitchhiker  0.00673157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1545  ribosomal protein L11  56.62 
 
 		 140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.42039  normal  0.523061 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2166  50S ribosomal protein L11P  55.15 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0218611  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1740  50S ribosomal protein L11  52.94 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0698  ribosomal protein L11  54.01 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0115104  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1764  50S ribosomal protein L11  52.94 
 
 		 141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00263233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0447  50S ribosomal protein L11P  57.34 
 
 		 143 aa  160  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06120  50S ribosomal protein L11  56.64 
 
 		 143 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4013  ribosomal protein L11  52.9 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0451516  hitchhiker  0.000000302185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08720  50S ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444282  hitchhiker  0.00204472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0826  50S ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0222387  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2552  50S ribosomal protein L11  52.9 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000438423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3920  50S ribosomal protein L11  56.64 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2686  ribosomal protein L11  58.82 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00682446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1040  50S ribosomal protein L11  52.9 
 
 		 141 aa  159  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00929805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2346  ribosomal protein L11  56.52 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2720  50S ribosomal protein L11  54.35 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000197883  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2156  50S ribosomal protein L11  54.17 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0919781  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5090  50S ribosomal protein L11  56.64 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000105007  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4329  50S ribosomal protein L11  58.78 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0265  50S ribosomal protein L11P  52.08 
 
 		 141 aa  157  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0359533  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0669  50S ribosomal protein L11  54.74 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.551066  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3937  50S ribosomal protein L11  58.78 
 
 		 143 aa  157  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0359  ribosomal protein L11  55.56 
 
 		 141 aa  157  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0141364  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00692  50S ribosomal protein L11  58.04 
 
 		 148 aa  157  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000124233  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2335  50S ribosomal protein L11  57.34 
 
 		 143 aa  157  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345629  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2284  50S ribosomal protein L11  55.56 
 
 		 141 aa  157  6e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000809352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0181  LSU ribosomal protein L11P  54.29 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000449736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0642  50S ribosomal protein L11  54.35 
 
 		 141 aa  156  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0270272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1823  ribosomal protein L11  53.28 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2724  ribosomal protein L11  58.33 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.239254  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1531  50S ribosomal protein L11  55.07 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000330995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0308  50S ribosomal protein L11  54.35 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000575936  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0847  50S ribosomal protein L11  54.35 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000114172  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23980  LSU ribosomal protein L11P  54.23 
 
 		 143 aa  155  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0817103  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1451  50S ribosomal protein L11  54.93 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0476  50S ribosomal protein L11  55.94 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000067383  normal  0.0123717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0443  50S ribosomal protein L11  55.94 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.273232  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0178  50S ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0183986  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27771  50S ribosomal protein L11  51.39 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0274  ribosomal protein L11  56.62 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000206726  hitchhiker  0.00329613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0406  50S ribosomal protein L11  52.9 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2076  ribosomal protein L11  54.41 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2992  50S ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0634  50S ribosomal protein L11  52.17 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0473  50S ribosomal protein L11  55.94 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.015667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0696  50S ribosomal protein L11P  55.22 
 
 		 142 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4760  50S ribosomal protein L11  55.94 
 
 		 143 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000974914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0315  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000167318  normal  0.214276 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0574  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000824953  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3435  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0613372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2471  50S ribosomal protein L11  52.08 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.407768  normal  0.0793834 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0264  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0928671  normal  0.597405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2771  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.305976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0560  50S ribosomal protein L11  57.04 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000566986  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0255  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0246755  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0336  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0811079  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1374  50S ribosomal protein L11  52.9 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000219538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4773  50S ribosomal protein L11  56.55 
 
 		 142 aa  154  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0832253  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0237  50S ribosomal protein L11  56.2 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.128931  normal  0.0118731 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4287  50S ribosomal protein L11  53.85 
 
 		 144 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000848232  hitchhiker  0.000000453889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0410  50S ribosomal protein L11  56.64 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0119247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2852  50S ribosomal protein L11  57.66 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393005  normal  0.399654 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01050  ribosomal protein L11  55.15 
 
 		 140 aa  154  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.27734e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0203  50S ribosomal protein L11  52.78 
 
 		 142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000658159  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02241  50S ribosomal protein L11  52.08 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02221  50S ribosomal protein L11  52.08 
 
 		 141 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.818188  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0254  50S ribosomal protein L11  54.01 
 
 		 145 aa  154  6e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000149943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0443  50S ribosomal protein L11  56.34 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1180  50S ribosomal protein L11  56.62 
 
 		 144 aa  153  8e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00213235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3455  50S ribosomal protein L11P  56.3 
 
 		 143 aa  153  8e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175537  normal  0.270352 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0094  50S ribosomal protein L11  54.17 
 
 		 141 aa  153  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0302  50S ribosomal protein L11  56.93 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0441199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4680  50S ribosomal protein L11  54.68 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00022611  decreased coverage  0.00273455 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1057  50S ribosomal protein L11  54.01 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0098  50S ribosomal protein L11  53.47 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000446948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0127  50S ribosomal protein L11  54.17 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000622779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0108  50S ribosomal protein L11  54.17 
 
 		 141 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.878e-62 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3790  50S ribosomal protein L11  55.47 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>