24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2492 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  738    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  48.22 
 
 
351 aa  298  8e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  43.63 
 
 
344 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  44.48 
 
 
364 aa  280  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  43.79 
 
 
349 aa  278  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  44.81 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  44.81 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  44.81 
 
 
356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  43.24 
 
 
365 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  44.12 
 
 
354 aa  257  3e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  42.35 
 
 
363 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  43.53 
 
 
354 aa  255  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  43.75 
 
 
360 aa  250  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  43.92 
 
 
380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  43.64 
 
 
353 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  43.61 
 
 
393 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  43.67 
 
 
383 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  43.16 
 
 
361 aa  228  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  41.18 
 
 
414 aa  220  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  40.91 
 
 
350 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  39.7 
 
 
384 aa  206  7e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  101  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  25.14 
 
 
810 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  29.56 
 
 
610 aa  46.2  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>