280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1580 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  59.5 
 
 		 229 aa  248  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  58.21 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  58.21 
 
 		 229 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  58.54 
 
 		 220 aa  247  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  57.43 
 
 		 242 aa  244  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  60.8 
 
 		 217 aa  244  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  59.9 
 
 		 229 aa  242  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  57.43 
 
 		 214 aa  241  6e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  59.9 
 
 		 222 aa  241  6e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  58.79 
 
 		 221 aa  236  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  59 
 
 		 220 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  58.38 
 
 		 222 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  54.11 
 
 		 211 aa  231  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  59.09 
 
 		 231 aa  230  9e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  56.22 
 
 		 215 aa  228  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  57.58 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  57.07 
 
 		 230 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  57.36 
 
 		 222 aa  221  7e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  52.24 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  50 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  53.77 
 
 		 195 aa  201  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  47.09 
 
 		 210 aa  197  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  44.61 
 
 		 211 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  51.01 
 
 		 195 aa  194  6e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  47.45 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  45.45 
 
 		 198 aa  186  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  42.71 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  45.83 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  45.83 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  48.47 
 
 		 197 aa  178  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  42.42 
 
 		 200 aa  175  5e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  43.96 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  42.35 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  43.37 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  43.15 
 
 		 204 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  40.51 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  39.9 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  42.26 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  42.26 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  40.89 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  44.05 
 
 		 206 aa  168  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  43.22 
 
 		 210 aa  168  6e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  43.35 
 
 		 212 aa  167  8e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  43.45 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  44.05 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  44.05 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  43.45 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  38.81 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  42.64 
 
 		 197 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  47.43 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  41.71 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  40.38 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  47.65 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  41.79 
 
 		 197 aa  161  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  42 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  37.81 
 
 		 205 aa  161  7e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  37.76 
 
 		 196 aa  161  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  43.94 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  46.33 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  46.47 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  46.33 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  44.85 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  41.87 
 
 		 196 aa  153  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  38.07 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  40.78 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  40.78 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  40.78 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  45.16 
 
 		 194 aa  151  5e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  40.78 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  40.78 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  41.45 
 
 		 193 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  42.49 
 
 		 194 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  40.29 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  43.39 
 
 		 194 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  42.41 
 
 		 195 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  44.21 
 
 		 202 aa  149  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  41.27 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  41.27 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  41.81 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  40.38 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  40.29 
 
 		 202 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  39.9 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  41.24 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  41.24 
 
 		 202 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  41.62 
 
 		 194 aa  124  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  37.65 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  29.86 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1714  ATPase  35.24 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000845008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 1287 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  25.62 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>