160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3267 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  62.5 
 
 		 221 aa  248  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  58.82 
 
 		 229 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  61 
 
 		 220 aa  244  8e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  58.33 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  58.33 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  57.84 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  58.45 
 
 		 220 aa  241  7e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  60.41 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  57.21 
 
 		 222 aa  239  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  58 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  56.1 
 
 		 229 aa  236  1e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  58.71 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  54.11 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  57.21 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  56.72 
 
 		 231 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  56.44 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  55.28 
 
 		 222 aa  220  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  58.29 
 
 		 215 aa  218  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  54.23 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  53.54 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  56 
 
 		 195 aa  208  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  47.34 
 
 		 210 aa  195  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  53.27 
 
 		 195 aa  187  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  48.84 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  48.84 
 
 		 201 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  47.7 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  49.08 
 
 		 198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  47.13 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  46.55 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  41.41 
 
 		 196 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  46.55 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  46.86 
 
 		 211 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  46.55 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  45.4 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  42.72 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  47.7 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  46.55 
 
 		 199 aa  175  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  46.86 
 
 		 212 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  47.13 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  47.13 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  47.15 
 
 		 229 aa  172  1.9999999999999998e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  45.59 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  39.09 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  49.68 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  40.66 
 
 		 205 aa  169  4e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  42.64 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  41.52 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  46.19 
 
 		 197 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  40.5 
 
 		 204 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  40.5 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  42.13 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  43.22 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  38.81 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  38.31 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  43.15 
 
 		 194 aa  148  5e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  39.89 
 
 		 205 aa  148  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  44.1 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  45.6 
 
 		 215 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  43.59 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  45.56 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  45.56 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  45.56 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  45.56 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  45.56 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  45.56 
 
 		 202 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  46.67 
 
 		 202 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  46.15 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  141  6e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  46.95 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  45.05 
 
 		 202 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  40 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  40.59 
 
 		 197 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  43.6 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  41.36 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  42.7 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  42.7 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  43.6 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  38.66 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  41.05 
 
 		 194 aa  134  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  40.51 
 
 		 202 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  41.58 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  38.78 
 
 		 193 aa  132  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  39.38 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  35.75 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  40.4 
 
 		 194 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  29.03 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 1287 aa  54.7  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.83 
 
 		 345 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.41 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  31.62 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.45 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>