29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0336 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0336  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  100 
 
 		 394 aa  806    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4043  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.87 
 
 		 394 aa  342  5e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2515  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  49.49 
 
 		 395 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.991601 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004305  sugar kinases ribokinase family  38.44 
 
 		 413 aa  264  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3293  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  38.48 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2512  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  41.75 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731479 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4040  hypothetical protein  34.09 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0203  hypothetical protein  35.01 
 
 		 358 aa  160  4e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0333  hypothetical protein  37.89 
 
 		 387 aa  154  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2787  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  35.96 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.415934  normal  0.173468 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 313 aa  57.4  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1923  Nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  36.46 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3641  pfkB family carbohydrate kinase  25.65 
 
 		 442 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1600  PfkB family carbohydrate kinase  30.37 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.744108 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0444  purine deoxyribosyltransferase  28.68 
 
 		 146 aa  51.2  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0570339  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0969  purine deoxyribosyltransferase  33.33 
 
 		 147 aa  50.1  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0548717  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0433  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase superfamily protein  28.57 
 
 		 182 aa  47  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.485819  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3945  carbohydrate kinase, PfkB  40 
 
 		 285 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.082303  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5342  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  31.3 
 
 		 143 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  29.13 
 
 		 306 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 		 315 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4553  ribokinase-like domain-containing protein  27.61 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1343  nucleoside 2-deoxyribosyltransferase  28.95 
 
 		 142 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  29.53 
 
 		 318 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1182  purine deoxyribosyltransferase  30.97 
 
 		 147 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2246  hypothetical protein  33.7 
 
 		 145 aa  44.3  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.01103  normal  0.0213561 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>