18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3141 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3141  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  462  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.129384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2500  hypothetical protein  99.14 
 
 		 233 aa  457  9.999999999999999e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.774455  normal  0.0669235 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1217  hypothetical protein  79.74 
 
 		 232 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01333  Dihydroorotate dehydrogenase 2  70.22 
 
 		 233 aa  325  5e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1717  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.78 
 
 		 252 aa  218  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0333  hypothetical protein  47.53 
 
 		 227 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2727  hypothetical protein  44.83 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.247415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001037  hypothetical protein  45.37 
 
 		 231 aa  199  3.9999999999999996e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0006  hypothetical protein  45.41 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1310  hypothetical protein  43.17 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04748  hypothetical protein  44.2 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0185  hypothetical protein  41.41 
 
 		 234 aa  187  2e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2299  permease of the major facilitator superfamily  43.18 
 
 		 228 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0872  hypothetical protein  43.97 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0685  hypothetical protein  44.16 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0782  hypothetical protein  43.1 
 
 		 232 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0453  hypothetical protein  28.19 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0273  hypothetical protein  25.64 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.300217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>