More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2621 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  585  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1255  chaperone protein DnaJ  45.67 
 
 
297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.559961  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  40.06 
 
 
381 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  35.31 
 
 
381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0156  chaperone protein DnaJ  34.29 
 
 
377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1308  DnaJ-like molecular chaperone  38.93 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.571116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.48 
 
 
287 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  38.49 
 
 
287 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.14 
 
 
334 aa  195  9e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  36.74 
 
 
380 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12140  predicted protein  39.66 
 
 
304 aa  193  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1082  chaperone protein DnaJ  35.38 
 
 
369 aa  191  8e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.248799  normal  0.102661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.14 
 
 
289 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3619  chaperone DnaJ domain protein  36.04 
 
 
326 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2295  chaperone protein DnaJ  33.62 
 
 
374 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  38.98 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2626  chaperone DnaJ  37.46 
 
 
326 aa  188  7e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18790  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  34.81 
 
 
325 aa  188  8e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0641376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  34.67 
 
 
324 aa  188  8e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  38.14 
 
 
307 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  36.49 
 
 
298 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3908  chaperone DnaJ domain protein  38.89 
 
 
301 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2553  chaperone DnaJ domain protein  39.24 
 
 
309 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.373438  normal  0.0279276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0217  chaperone DnaJ domain protein  38.64 
 
 
297 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000962373  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1815  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.92 
 
 
323 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  36.28 
 
 
318 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  34.97 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  34.97 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  35.01 
 
 
384 aa  184  1.0000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5146  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.39 
 
 
392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0934  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.43 
 
 
320 aa  183  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0828376 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  39.86 
 
 
299 aa  182  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3023  chaperone DnaJ domain-containing protein  39.49 
 
 
319 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  36.01 
 
 
313 aa  180  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0248  chaperone protein DnaJ  33.43 
 
 
375 aa  180  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.821018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2569  chaperone DnaJ domain protein  36.12 
 
 
318 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.416299  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  36.01 
 
 
341 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  37.09 
 
 
301 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2665  chaperone DnaJ domain protein  35.33 
 
 
318 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01180  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  37.42 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.18 
 
 
315 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0145  chaperone protein DnaJ  32.96 
 
 
376 aa  179  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813386  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0013  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.67 
 
 
302 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000027802  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0426  chaperone DnaJ domain protein  38.08 
 
 
294 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.011162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0771  DnaJ-like curved DNA-binding protein  36.64 
 
 
296 aa  178  8e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.63005e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  37.59 
 
 
293 aa  178  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2474  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.03 
 
 
320 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.553887 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  37.33 
 
 
306 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1756  chaperone protein DnaJ  31.74 
 
 
384 aa  176  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.426165  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3332  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.13 
 
 
324 aa  176  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.870111  normal  0.639314 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3444  chaperone DnaJ domain protein  34.19 
 
 
339 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903918 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  37.38 
 
 
309 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3476  chaperone protein DnaJ  33.33 
 
 
369 aa  175  7e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.05 
 
 
316 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2015  chaperone DnaJ  36.89 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0999133  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  37 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  37 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  37 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  37 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  37 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  37 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3283  chaperone DnaJ domain protein  33.65 
 
 
335 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0150479  normal  0.970899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0143  chaperone DnaJ domain-containing protein  37.07 
 
 
297 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000524271  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  33.65 
 
 
335 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  35.43 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2189  hypothetical protein  36.46 
 
 
296 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  36.67 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  35.43 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  35.43 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  35.43 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  35.43 
 
 
306 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  36.67 
 
 
306 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  35.29 
 
 
331 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.01 
 
 
319 aa  169  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1602  chaperone DnaJ domain protein  34.84 
 
 
297 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000490827 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3806  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.88 
 
 
328 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0918  heat shock protein DnaJ-like  33.44 
 
 
333 aa  169  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.555506  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  35.8 
 
 
330 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  36.54 
 
 
298 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0213  chaperone DnaJ domain-containing protein  36.21 
 
 
291 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.985431 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2217  hypothetical protein  36.81 
 
 
296 aa  168  7e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0441  chaperone protein DnaJ  32.02 
 
 
378 aa  168  8e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000821274  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4731  chaperone DnaJ domain-containing protein  33.75 
 
 
334 aa  168  9e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.110722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1670  chaperone protein DnaJ  33.15 
 
 
382 aa  167  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.890746  normal  0.0271561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  36.84 
 
 
330 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  35.1 
 
 
313 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  33.55 
 
 
326 aa  167  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2100  heat shock protein DnaJ-like  37.26 
 
 
320 aa  167  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0014  phage prohead protease  34.02 
 
 
294 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.483613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
325 aa  166  5e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2511  heat shock protein DnaJ domain protein  33.12 
 
 
316 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0350748  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0442  chaperone DnaJ domain protein  34.67 
 
 
325 aa  166  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  33.54 
 
 
330 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0979  chaperone DnaJ-like  30.63 
 
 
401 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  33.33 
 
 
315 aa  165  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3756  chaperone DnaJ domain protein  37.7 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.144463  normal  0.652228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  34.46 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6322  heat shock protein DnaJ domain protein  34.84 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04440  DnaJ-class molecular chaperone with C-terminal Zn finger domain  35.69 
 
 
332 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3900  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  34.23 
 
 
313 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.195824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>