More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0769 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  65.61 
 
 
472 aa  649    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  100 
 
 
475 aa  973    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  62.66 
 
 
474 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  63.36 
 
 
478 aa  580  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  61.97 
 
 
477 aa  578  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  61.97 
 
 
477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  62.18 
 
 
477 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  62.18 
 
 
477 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  62.77 
 
 
472 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  50.32 
 
 
473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  50.22 
 
 
469 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.12 
 
 
517 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.85 
 
 
490 aa  392  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  45.68 
 
 
499 aa  385  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  43.8 
 
 
510 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  43.88 
 
 
483 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  43.88 
 
 
484 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  44.64 
 
 
481 aa  347  2e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.56 
 
 
474 aa  343  4e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.37 
 
 
474 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  42.16 
 
 
474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  39.79 
 
 
467 aa  336  5e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  41.79 
 
 
477 aa  329  6e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  43.6 
 
 
469 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.54 
 
 
469 aa  317  3e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  39.29 
 
 
445 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  42.17 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.48 
 
 
499 aa  300  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  41.28 
 
 
465 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  37.01 
 
 
1553 aa  277  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  27.82 
 
 
449 aa  126  7e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  27.18 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  25.74 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  26.75 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0294  phosphoglucosamine mutase  26.07 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000894137  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  26.49 
 
 
430 aa  111  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  25.48 
 
 
430 aa  111  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  24.95 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1634  phosphoglucosamine mutase  27.06 
 
 
451 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.428714  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1690  phosphoglucosamine mutase  27.06 
 
 
451 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  25.91 
 
 
444 aa  108  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2342  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.16 
 
 
433 aa  106  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0286234  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1224  phosphoglucosamine mutase  26.62 
 
 
459 aa  106  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  25.65 
 
 
430 aa  106  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0242  phosphoglucosamine mutase  26.16 
 
 
442 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  27.21 
 
 
447 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1528  phosphoglucosamine mutase  25.38 
 
 
447 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.226614  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  26.57 
 
 
447 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2609  phosphoglucosamine mutase  26.84 
 
 
443 aa  103  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  29.61 
 
 
443 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  25.64 
 
 
448 aa  103  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2619  phosphoglucosamine mutase  27.97 
 
 
444 aa  103  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317995  normal  0.824493 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  26.33 
 
 
447 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  25.39 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0481  phosphoglucosamine mutase  27.13 
 
 
445 aa  102  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  26.71 
 
 
453 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  27.79 
 
 
447 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1419  phosphoglucosamine mutase  25.42 
 
 
428 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0124783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  25.81 
 
 
448 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0960  phosphoglucosamine mutase  29.88 
 
 
444 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.381116  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  24.95 
 
 
448 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  101  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  27.76 
 
 
469 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3490  phosphoglucosamine mutase  25.31 
 
 
450 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.731606  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  25.97 
 
 
449 aa  101  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  25.59 
 
 
448 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3195  phosphoglucosamine mutase  24.9 
 
 
450 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2490  phosphoglucosamine mutase  26.6 
 
 
449 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3629  phosphoglucosamine mutase  26.95 
 
 
450 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.917297  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1789  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 
446 aa  100  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4923  phosphoglucosamine mutase  28.39 
 
 
447 aa  100  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.106408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62840  phosphoglucosamine mutase  27.35 
 
 
445 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  27.57 
 
 
449 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1006  phosphoglucosamine mutase  26.64 
 
 
455 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  26.5 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2638  phosphoglucosamine mutase  27.94 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  28.53 
 
 
449 aa  99.8  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0605  phosphoglucosamine mutase  27.08 
 
 
451 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000599128  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  26.29 
 
 
454 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0409  phosphoglucosamine mutase  26.82 
 
 
451 aa  99  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000346871  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1359  phosphoglucosamine mutase  26.3 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0209  phosphoglucosamine mutase  28.38 
 
 
460 aa  99  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  26.11 
 
 
436 aa  98.6  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  26.56 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2324  phosphoglucosamine mutase  27.62 
 
 
448 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2566  phosphoglucosamine mutase  25.31 
 
 
466 aa  99  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.711802  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  25.53 
 
 
453 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3769  phosphoglucosamine mutase  25.99 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00158807  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2256  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  25.37 
 
 
453 aa  98.2  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.361439  decreased coverage  0.00522565 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1740  Phosphoglucosamine mutase  26.27 
 
 
454 aa  97.8  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.533946  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  25.93 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0171  phosphoglucosamine mutase  26.74 
 
 
450 aa  97.8  4e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0284476  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  23.77 
 
 
452 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>