More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3451 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3451  glutamyl-tRNA reductase  100 
 
 		 409 aa  836    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.341697  normal  0.0956626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3600  glutamyl-tRNA reductase  27 
 
 		 422 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.779704 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2361  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.99 
 
 		 429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2564  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  27.17 
 
 		 423 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.508916  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2642  glutamyl-tRNA reductase  26.18 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5179  glutamyl-tRNA reductase  26.72 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000059064 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0993  glutamyl-tRNA reductase  27.89 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2887  glutamyl-tRNA reductase  30.26 
 
 		 432 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.171093 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2164  glutamyl-tRNA reductase  27.05 
 
 		 464 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.317468  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3252  glutamyl-tRNA reductase  26.46 
 
 		 425 aa  142  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000725008  normal  0.10707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0758  glutamyl-tRNA reductase  29.45 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1348  glutamyl-tRNA reductase  27.9 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2469  glutamyl-tRNA reductase  26.85 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3645  glutamyl-tRNA reductase  26.85 
 
 		 428 aa  141  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6799  glutamyl-tRNA reductase  25.93 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3598  glutamyl-tRNA reductase  28.81 
 
 		 432 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.928843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0441  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 		 432 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.271355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1606  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  29.88 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.495518  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1052  glutamyl-tRNA reductase  30.58 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103209  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0523  Glutamyl-tRNA reductase  31.53 
 
 		 439 aa  139  8.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0789  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 418 aa  139  8.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143605  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1462  glutamyl-tRNA reductase  29.73 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1528  glutamyl-tRNA reductase  29.65 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2564  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.734492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2593  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0415  glutamyl-tRNA reductase  27.79 
 
 		 432 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.818412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0732  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1059  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 426 aa  138  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2929  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0483  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.675645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1481  glutamyl-tRNA reductase  28.1 
 
 		 380 aa  138  2e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2720  glutamyl-tRNA reductase  28.22 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0511  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0773  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3554  glutamyl-tRNA reductase  25.94 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0359238  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0505  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3600  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0510  glutamyl-tRNA reductase  28.23 
 
 		 420 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0928  glutamyl-tRNA reductase  28.07 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.878615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3613  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.268717  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0971  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0563906  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1942  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0675  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3589  glutamyl-tRNA reductase  29.61 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.472177  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3521  glutamyl-tRNA reductase  29.47 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.216045  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0764  glutamyl-tRNA reductase  29.79 
 
 		 428 aa  137  5e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.014297  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0760  glutamyl-tRNA reductase  28.29 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0583229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2122  glutamyl-tRNA reductase  30.07 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0115057  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1250  glutamyl-tRNA reductase  25.69 
 
 		 464 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4457  glutamyl-tRNA reductase  28 
 
 		 425 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4311  glutamyl-tRNA reductase  27.32 
 
 		 443 aa  136  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3182  glutamyl-tRNA reductase  25.97 
 
 		 444 aa  136  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.447299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0341  glutamyl-tRNA reductase  29.05 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0722  glutamyl-tRNA reductase  28.43 
 
 		 427 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3064  glutamyl-tRNA reductase  25.55 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0847695  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2761  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1840  glutamyl-tRNA reductase  24.34 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.20758  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2381  glutamyl-tRNA reductase  29.53 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.370864 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1121  glutamyl-tRNA reductase  24.82 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.710663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04547  glutamyl-tRNA reductase  27.76 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0437  glutamyl-tRNA reductase  28.95 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.760471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0390  glutamyl-tRNA reductase  27.09 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0690188  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1229  glutamyl-tRNA reductase  28.11 
 
 		 422 aa  134  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000302896  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2211  glutamyl-tRNA reductase  29.74 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.271306  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41480  glutamyl-tRNA reductase  30 
 
 		 408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.340284  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1108  glutamyl-tRNA reductase  29.14 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4602  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0208  glutamyl-tRNA reductase  26.12 
 
 		 441 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4557  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  132  9e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5878  glutamyl-tRNA reductase  28.31 
 
 		 446 aa  132  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179812  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4363  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4199  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4210  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0948  glutamyl-tRNA reductase  30.52 
 
 		 425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4749  glutamyl-tRNA reductase  30.19 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168503  normal  0.0710553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4553  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4698  glutamyl-tRNA reductase  27.16 
 
 		 444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1750  glutamyl-tRNA reductase  28.91 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2492  glutamyl-tRNA reductase  30.87 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.59007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0959  glutamyl-tRNA reductase  26.7 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2256  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3689  glutamyl-tRNA reductase  26.98 
 
 		 416 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2283  glutamyl-tRNA reductase  27.52 
 
 		 424 aa  130  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2582  glutamyl-tRNA reductase  26.16 
 
 		 443 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1908  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00010664  normal  0.872325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1914  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000422832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1362  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000971063  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1972  glutamyl-tRNA reductase  28.82 
 
 		 418 aa  130  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000439602  normal  0.904808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1590  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  26.11 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1757  glutamyl-tRNA reductase  26.87 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000105006  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0279  glutamyl-tRNA reductase  26.06 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3377  glutamyl-tRNA reductase  27.02 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2338  glutamyl-tRNA reductase  27.99 
 
 		 434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1546  glutamyl-tRNA reductase  28.53 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0564626  normal  0.139086 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0504  glutamyl-tRNA reductase  25.85 
 
 		 438 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2473  glutamyl-tRNA reductase  28.57 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4584  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0650  glutamyl-tRNA reductase  26.9 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1051  glutamyl-tRNA reductase  28.7 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00451156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5315  glutamyl-tRNA reductase  29.35 
 
 		 422 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>