215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3045 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3045  glycerate kinase  100 
 
 		 377 aa  757    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0181471 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1637  glycerate kinase 1  42.82 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0262  glycerate kinase 2  42.82 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0173  glycerate kinase  42.82 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0201  glycerate kinase  42.55 
 
 		 394 aa  272  7e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0571  glycerate kinase II  41.87 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0578  glycerate kinase II  41.87 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.837942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0632  glycerate kinase II  41.87 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.82847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0573  glycerate kinase II  41.87 
 
 		 382 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0151  glycerate kinase  42.51 
 
 		 381 aa  263  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219073  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2594  glycerate kinase  41.98 
 
 		 379 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22950  Glycerate kinase  42.09 
 
 		 380 aa  260  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3239  glycerate 2-kinase  42.18 
 
 		 379 aa  260  3e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3551  glycerate kinase  40.92 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.565329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0148  glycerate kinase  40.91 
 
 		 385 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5030  glycerate kinase  41.14 
 
 		 380 aa  256  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000882  glycerate kinase  39.95 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0146  glycerate kinase  40.91 
 
 		 385 aa  256  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.214827  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3181  glycerate kinase 2  40.8 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.345716  normal  0.43286 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3165  glycerate kinase 2  40.8 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.589174  normal  0.0595423 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3118  glycerate kinase 2  40.8 
 
 		 380 aa  255  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.855661  normal  0.775701 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5139  glycerate kinase  39.95 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0615  glycerate kinase II  41.24 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0551  glycerate kinase II  41.51 
 
 		 381 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00464  glycerate kinase II  41.51 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0176  glycerate kinase  40.48 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.246906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0871  glycerate 2-kinase  40.11 
 
 		 380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1896  glycerate kinase  41.58 
 
 		 384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0197  glycerate kinase  40.75 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0775115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00469  hypothetical protein  41.51 
 
 		 381 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0846  glycerate kinase  41.55 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0559  glycerate kinase II  41.24 
 
 		 381 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3279  glycerate kinase 2  40.53 
 
 		 380 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.809605  normal  0.297665 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2012  glycerate kinase 2  39.73 
 
 		 383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.197664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3529  glycerate kinase  41.4 
 
 		 384 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0153  glycerate kinase  40.75 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.430651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3109  glycerate kinase II  41.51 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0587  glycerate kinase II  41.51 
 
 		 381 aa  252  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3392  glycerate kinase  40.65 
 
 		 381 aa  252  7e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3099  Glycerate kinase  41.24 
 
 		 381 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3100  glycerate kinase 2  40.53 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06863  glycerate kinase  40.75 
 
 		 377 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2534  glycerate kinase  40.16 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0812  glycerate kinase  42.36 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1860  Glycerate kinase  40.11 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.817432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4052  glycerate kinase  40.27 
 
 		 378 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2685  Glycerate kinase  40.11 
 
 		 381 aa  249  8e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0111  glycerate kinase  40.27 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0404  glycerate kinase  41.22 
 
 		 381 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0467091  decreased coverage  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3398  glycerate kinase  42.3 
 
 		 380 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.13407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3419  glycerate kinase I  41.11 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0581  Glycerate kinase  41.11 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0576  glycerate kinase I  41.11 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4436  glycerate kinase I  41.11 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.109938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3313  glycerate kinase I  41.11 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3602  glycerate kinase I  41.11 
 
 		 381 aa  247  3e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02989  glycerate kinase I  41.11 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02940  hypothetical protein  41.11 
 
 		 408 aa  246  4e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3602  glycerate kinase  40.53 
 
 		 381 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3115  glycerate kinase  41.05 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.630245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2915  glycerate kinase  40.27 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4081  glycerate kinase  40 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.063717 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2458  glycerate kinase  40.37 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2507  glycerate kinase  40.37 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.724279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3566  glycerate kinase I  40.21 
 
 		 381 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.816007 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4927  glycerate kinase  40.85 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2908  glycerate kinase  40.21 
 
 		 379 aa  243  5e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1926  glycerate kinase  39.63 
 
 		 371 aa  243  6e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0147  glycerate kinase  39.95 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1342  glycerate kinase  40.81 
 
 		 378 aa  241  2e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3234  glycerate kinase I  40.32 
 
 		 381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0579  glycerate kinase  41.83 
 
 		 353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.513033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1142  glycerate kinase  38.81 
 
 		 382 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.45984  unclonable  0.0000000352544 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2858  glycerate kinase  38.34 
 
 		 379 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.368112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2051  glycerate kinase  40.63 
 
 		 378 aa  239  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.55697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2726  glycerate kinase  38.07 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2685  glycerate kinase  38.07 
 
 		 379 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0185  glycerate kinase  40.48 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000580262  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4326  hypothetical protein  43.56 
 
 		 381 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0612  glycerate kinase 1  42.05 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3178  glycerate kinase  40 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1770  glycerate kinase, putative  39.84 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2519  glycerate kinase  39.36 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122569 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0334  hypothetical protein  39.04 
 
 		 377 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1135  glycerate kinase  40.22 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0348  glycerate kinase  40.27 
 
 		 378 aa  237  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2637  glycerate kinase  38.07 
 
 		 379 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0645  glycerate kinase  40.53 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3623  glycerate kinase  39.68 
 
 		 386 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.304163  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1439  glycerate kinase  40.48 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.465286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03503  glycerate kinase  40.8 
 
 		 389 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0854  glycerate kinase  38.93 
 
 		 373 aa  236  6e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.69696  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0146  glycerate kinase  37 
 
 		 380 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000400769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2685  glycerate kinase  39.36 
 
 		 381 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.384968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2690  glycerate kinase  39.57 
 
 		 379 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2587  glycerate kinase  39.36 
 
 		 381 aa  235  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.692299 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0846  hypothetical protein  38.93 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0245025  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43390  Glycerate kinase  40.27 
 
 		 378 aa  233  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00316811  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0925  glycerate kinase  40 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000221042  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1524  glycerate kinase  39.78 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>