22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2557 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2557  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 		 375 aa  774    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.540349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4098  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.95 
 
 		 369 aa  206  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0714  Fibronectin type III domain protein  34.34 
 
 		 484 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2296  hypothetical protein  38.29 
 
 		 405 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0277626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0713  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.71 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0683119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6799  Fibronectin type III domain protein  25.56 
 
 		 406 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000311122  hitchhiker  0.00000000000294335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2860  Fibronectin type III domain protein  27.35 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000020084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0504  hypothetical protein  25.54 
 
 		 495 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.229451  normal  0.987624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.36 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2342  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.41 
 
 		 350 aa  50.4  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.69185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  33.59 
 
 		 850 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1442  putative hyaluronidase  25.86 
 
 		 1001 aa  47.4  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.980629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.37 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.33 
 
 		 639 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.37 
 
 		 704 aa  44.3  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  27.54 
 
 		 1471 aa  43.9  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1551  hypothetical protein  33.6 
 
 		 571 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1472  putative alpha-N-acetylgalactosaminidase  28.57 
 
 		 1588 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.9 
 
 		 1329 aa  43.1  0.007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  28.82 
 
 		 1164 aa  42.7  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.08 
 
 		 1007 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  25.16 
 
 		 1264 aa  42.7  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>