19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0511 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  32.64 
 
 
274 aa  162  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4472  hypothetical protein  36.33 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.370126 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  34.47 
 
 
277 aa  142  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  33.33 
 
 
276 aa  139  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  32.06 
 
 
287 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  29.29 
 
 
262 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12213  hypothetical protein  27.74 
 
 
264 aa  89.7  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  24.82 
 
 
258 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0899  hypothetical protein  45.59 
 
 
155 aa  56.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0900  hypothetical protein  34.33 
 
 
159 aa  47  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  31.03 
 
 
255 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0894  putative transmembrane anti-sigma factor  23.16 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0679919  normal  0.0128981 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3578  hypothetical protein  33.33 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1970  hypothetical protein  37.66 
 
 
137 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0162497  normal  0.0491254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  30.16 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  26.64 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  22.78 
 
 
246 aa  42.7  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0625  Anti-sigma K factor RskA  31.13 
 
 
206 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.793553 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>