13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4832 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4832  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  275  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.128133  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2002  hypothetical protein  56.03 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0988  hypothetical protein  54.23 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3298  hypothetical protein  50.97 
 
 		 218 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2397  EF hand domain-containing protein  50.32 
 
 		 218 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2853  hypothetical protein  40.48 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.652841  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1009  calcium-binding EF-hand  35.85 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2551  hypothetical protein  36.36 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0760261  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3380  signal transduction protein  44 
 
 		 209 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1629  signal transduction protein  30.48 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1553  hypothetical protein  65.62 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5798  Calcium-binding EF-hand-containing protein  48.39 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3217  calcium-binding EF-hand  40.68 
 
 		 190 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>