40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3157 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3157  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  241  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5007  hypothetical protein  56.04 
 
 		 99 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0211  hypothetical protein  56.04 
 
 		 93 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.191021 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4090  hypothetical protein  51.06 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0542229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4202  protein of unknown function DUF971  51.06 
 
 		 97 aa  97.1  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34940  hypothetical protein  51.76 
 
 		 93 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000878957  normal  0.981288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5290  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  88.2  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.0611065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1890  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.834244  normal  0.853534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1963  hypothetical protein  44.44 
 
 		 106 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64349  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1292  hypothetical protein  50 
 
 		 107 aa  84.3  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.952815  normal  0.316279 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2002  hypothetical protein  42.22 
 
 		 92 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6099  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1978  hypothetical protein  40 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.370192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4195  protein of unknown function DUF971  39.77 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.567549 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3352  hypothetical protein  34.38 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6148  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3819  protein of unknown function DUF971  35.16 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3736  hypothetical protein  35.16 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.147465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3678  hypothetical protein  33.7 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3677  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 107 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4192  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0049  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4885  hypothetical protein  32.98 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.624413 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3805  hypothetical protein  33.73 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0638296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1476  hypothetical protein  35.16 
 
 		 106 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.763244 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0978  protein of unknown function DUF971  29.03 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.039823 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0852  hypothetical protein  29.03 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2386  protein of unknown function DUF971  31.31 
 
 		 108 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.44562  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0679  hypothetical protein  56.1 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1632  hypothetical protein  29.35 
 
 		 135 aa  47  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0464057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0147  hypothetical protein  31.25 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.793552 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4130  hypothetical protein  25.53 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000631548 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0104  protein of unknown function DUF971  33.33 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6815  protein of unknown function DUF971  31.65 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2580  hypothetical protein  30.86 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.369567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2800  hypothetical protein  36.99 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.176742  normal  0.880482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0373  hypothetical protein  29.63 
 
 		 131 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0110  protein of unknown function DUF971  30.3 
 
 		 108 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1557  hypothetical protein  52 
 
 		 117 aa  40  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.147587  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5052  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>